１、投资主体不同：个人独资企业：指有一个投资主体并且是个人出资，按照有关规定在工商行政部门登记注册开办的企业。合资企业：指有两个或两个以上的投资主体共同出资，按照有关规定在工商行政部门登记注册开办的企业。
２、经营方式不同：个人独资企业：是一个人投资独立经营。合资企业是两个或两个以上的投资主体合作经营。
３、利润分配形式不同：个人独资企业是投资者个人自主经营，自负盈亏。合资企业投资者（两个或两个以上的人）共同经营，按出资比例，分享成果，共担风险。
４、投资人人数不同。个人独资企业的人数仅为一人，合伙企业为二人以上。
５、责任承担有所不同。个人独资企业仅由出资人一人承担无限责任，合伙企业则由全体合伙人承担连带无限责任。
独资是外国投资者在投资国单独进行投资或购买企业，由外商独立经营。国际上利用外资的一种形式。企业的所有权和经营权全部控制在外国投资者手中。外国投资者到本国之外的其他国家投资是为了扩大商品销售市场，获得原料和廉价劳动力。但也为投资国输入了资本，引进了先进技术和管理经验，培训了熟练的技术人才，增加了就业机会。该国为外资提供场地、劳动力、原料、动力和商品供应等，扩大了商品出口。我国也已从１９７９年以来开办外资独资企业。
合资是一种快速低成本进入新市场的有效方式。合资的一种普遍形式是大型跨国公司和经营地所在国的企业合作，从而能更容易地渗透入该国的市场。在这种情况下，跨国公司将提供产品和大部分用于发展的资源。而与之合资的经营地所在国的企业则负责提供专业技术和所在地的各种关系。
在税收上，这两种组织形式是没有区别对待的。
１、根据《中华人民共和国企业所得税法》规定，在中华人民共和国境内，企业和其他取得收入的组织（以下统称企业）为企业所得税的纳税人。
２、个人独资企业取得收入缴纳个人所得税（生产经营所得）
３、合伙企业以每一个合伙人为纳税义务人。合伙企业合伙人是自然人的，缴纳个人所得税；合伙人是法人和其他组织的，缴纳企业所得税。
４、其他税种的纳税基本一致。
１、通过股东投资获得资金；
２、制定公司章程；
３、确立公司名称、住所、经营范围、组织机构等；
４、申请设立登记。
根据《公司法》第七条规定，依法设立的公司，由公司登记机关发给公司营业执照。公司营业执照签发日期为公司成立日期。第十一条规定，设立公司必须依法制定公司章程。第二十九条规定，股东认足公司章程规定的出资后，由全体股东指定的代表或者共同委托的代理人向公司登记机关报送公司登记申请书、公司章程等文件，申请设立登记。
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