分公司注销原因：
公司注销有内部和外部两方面的原因，内部原因例如公司经营不善，市场不好等。外部原因例如被吊销、撤销等，具体如下：
股东或股东会作出公司解散决议；
公司依法宣告破产；
公司章程规定营业期限届满且不续；
公司章程或法律规定的解散事由出现；
公司因合并、分立解散；
公司被依法强制解散；
公司吊销或撤销后转注销。
分公司注销流程
第一：公司符合以下条件之一，可申请注销：
1、公司被依法宣告破产；
2、公司章程规定营业期限届满或者其他解散事由出现；
3、公司因合并、分立解散；
4、公司被依法责令关闭。
第二：注销程序：
一、形成注销公司的决议
二、税务审计（清算审计）
三、税务注销
四、工商注销
第三：具体操作
一、清算的步骤：
（一）成立清算组。
（二）展开清算工作。
清算组自成立之日起接管公司，开展以下业务：
1、接管公司财产；
2、了结公司未了业务；
3、收取债权、清理债务；
4、分配剩馀财产；
5、注销公司法人资格，吊销营业执照。
（三）通知债权人申报债权。
（四）提出清算方案。
清算组在清理公司财产、编制资产负债表和财产清单后，拟定提出清算方案，报股东会讨论通过或者主管机关确认。
清算方案的主要内容有：
1、清算费用；
2、应支付的职工工资、劳动保险费；
3、应缴纳的税款；
4、清偿公司债务。
（五）分配剩馀财产。
六、终结清算工作。
清算组在终结分配后，应制作清算终结报告，报股东会或主管机关认可后，申请注销公司法人资格，吊销营业执照。
办理税务、工商注销
（一）具体步骤如下：
（1）先到国税拿表格：按国税的要求填写、签字,、盖章、缴销发票、补税后，它会收回国税税务登记证，给你一张国税注销税务登记通知书。
（2）拿着国税的注销税务登记通知书，到地税拿表格，补税后，它会收回地税税务登记证，给你一张地税注销税务登记通知书。
（3）拿着两张通知书，销银行账户。
（4）拿通知书到工商局拿表格，然后交回工商局，然后吊销营业执照。
（二）应向登记机关提交下列文件：
（1）公司清算组织负责人签署的注销登记申请书；
（2）公司法定代表人签署的《公司注销登记申请书》；
（3）法院破产裁定、行政机关责令关闭的文件或公司依照《公司法》作出的决议或者决定；
（4）股东会或者有关机关确认的清算报告；
（5）税务部门出具的完税证明；
（6）银行出具的帐户注销证明；
（7）《企业法人营业执照》正、副本；
（8）法律、行政法规规定应当提交的其他文件。
注销分公司的损失如何申报扣除
《国家税务总局关于印发（跨地区经营汇总纳税企业所得税征收管理暂行办法）的通知》（国税发[ 2008]28号）第14条规定，撤销的分支机构，撤销当年剩余期限内应分摊的企业所得税款由总机构缴人中央国库。
第35条规定，分支机构注销后15日内，总机构应将分支机构注销情况报主管税务机关备案。
第36条规定，总机构及其分支机构除按纳税申报规定向主管税务机关报送相关资料外，还应报送《中华人民共和国企业所得税汇总纳税分支机构分配表》、财务会计决算报告和职工工资总额情况表。
第37条规定，分支机构的各项财产损失，应由分支机构所在地主管税务机关审核并出具证明后，再由总机构向所在地主管税务机关申报扣除。
根据上述规定，分公司在注销过程中的资产损失，注销时由分支机构所在地主管税务机关审核并出具证明，汇算清缴时由总机构向所在地主管税务机关申报扣除。
公司注销后如何进行清算
企业注销后的清算一般分为两个层面：
1、企业层面，就是从事实体生产经营的公司（清算的公司）应进行企业所得税的清算；
2、股东层面，指企业投资者的投资行为而取得的所得进行企业（个人）所得税清算。
企业终止生产经营开始清算之日的确定
1、企业章程规定的经营期限届满之日；
2、企业股东会、股东大会或类似机构决议解散之日；
3、企业依法被吊销营业执照、责令关闭或者被撤销之日；
4、企业被人民法院依法予以解散或宣告破产之日。
清算期确定、清算备案和时间要求
根据《财政部、国家税务总局关于企业清算业务企业所得税处理若干问题的通知》（财税〔2009〕60号）文件规定，企业应将整个清算期作为一个独立的纳税年度计算清算所得。因此，企业清算期所在的年度内，有两个所得税纳税年度，第一个纳税年度为1月1日到终止生产经营之日，第二个纳税年度为终止生产经营之日到注销税务登记之日。
（一）第一个纳税年度
企业在年度中间终止生产经营，按照公司法、企业破产法等规定需要进行清算的，依据企业所得税法第五十五条规定，应将终止生产经营当年度1月1日至实际经营终止之日作为一个纳税年度，于实际经营终止之日起60日内完成当年度企业所得税汇算清缴，结清当年度应缴（应退）企业所得税税款。
（二）第二个纳税年度
进入清算期的企业应对清算事项，报主管税务机关备案。企业应当自终止生产经营活动开始清算之日起15日内向主管税务机关提交《企业清算所得税事项备案表》并附送以下备案资料：
1、纳税人终止正常生产经营活动并开始清算的证明文件或材料。
2、管理人或清算组联络人员名单及联系方式。
3、清算方案或计划书。
4、欠税报告表。
（三）企业在清算期内取得来源于我国境外的所得，仍须依据《财政部、国家税务总局关于企业境外所得税收抵免有关问题的通知》（财税〔2009〕125号）的相关规定，按照分国（地区）不分项原则，采取“抵免法”，计算按照我国税法计算的在我国境内应补缴的企业所得税税额。
（四）企业应当自清算结束之日起15日内，向主管税务机关报送《中华人民共和国企业清算所得税申报表》及其附表和下列资料，完成清算所得税申报，结清税款。
1、清算报告或清算方案或破产财产变价方案的执行情况说明；
2、清算期间资产负债表、利润表（依据相关法律法规要求须经中介机构审计的，还应同时附送具有法定资质的中介机构的审计报告）；
3、资产盘点表；
4、清算所得计算过程的说明；
5、具备下列情形的，还需报送资产评估的说明和相关证明材料。
（1）资产处置交易双方存在关联关系的；
（2）采取可变现价值确认资产处置所得或损失的。
6、企业清算结束如有尚未处置的财产，同时报送尚未处置的财产清单、清算组指定保管人的授权委托书、组织机构代码证或身份证复印件。
7、股东分配剩余财产明细表。
8、非营利组织还应同时附着清算结束后其剩余财产的处置情况说明。
通过上文介绍，公司到登记机关办理公司注销程序之前一定要依法进行公司清算，包括终止生产经营销售活动、了结公司事务、了结民事诉讼、清理债权和债务和分配剩余财产等。清算组在清理公司财产、编制资产负债表和财产清单后，拟定提出清算方案，报股东会讨论通过或者主管机关确认。看完上文的介绍，如果您对分公司注销流程、费用具体是有什么标准还存在疑惑的或者遇到这方面的律师的，建议直接咨询找法网律师。
