所谓债券投资是指购买债务人发行的债务凭证，也就是说把钱直接借给债务人，通过每年获取利息和到期获取本金而取得收益。而基金投资则是通过购买基金份额把钱交给基金管理公司进行投资管理，通过基金净值的增长和分红来实现收益。具体来说，二者的区别主要有以下几点：
首先，债券投资反映的是一种债权债务关系，投资者购买后就成为该公司的债权人，债务人则保证按期付息和到期还本；而基金投资则反映的是一种信托关系，投资者通过合同（基金合同）把钱委托给基金管理公司管理，而基金管理公司则可以按照基金合同的规定自主投资于股票、债券等。
其次，债券投资收益比较确定，而基金投资收益存在一定的不确定性。设想一下，购买了100元的国债（其票面利率3%，期限5年），则收益基本上就已经确定下来了：在今后4年内每年能得到3元的利息收入，在第5年则能得到103元的本息收入。相比之下，基金投资的收益就存在着较大的不确定性因素，它与基金管理公司的投资运作能力密切相关。比如说，在今天申购了100份某只开放式基金，净值是1.00元。经过一年的运作，基金净值上升为1.10元，则这一年的基金投资收益就是10%，但如果基金的投资组合收益为负，则净值会低于1元，投资人面临损失。
最后，从中长期来看基金（特别是股票型基金）投资收益高于债券投资。由于回报总是与风险成正比的，没有风险就没有回报，债券投资在规避风险的同时也就减少了回报；而基金则通过投资股票、债券，承担了风险，因此其收益从中长期来看是高于债券投资的。
