1、设立主体存在瑕疵。
即发起人或者股东主体资格欠缺或意思表示有缺陷，其中包括：发起人或股东中有无行为能力人或限制行为能力人；某发起人或者股东因为欺诈、胁迫而作出设立公司的意思表示；发起人或者股东明知其行为将侵害债权人的利益而作出设立的意思表示。
2、设立行为本身有瑕疵。
即设立公司时违反法定条件和法定程序的要求，或者违反其他强制性规定。主要表现为：
①发起人没有认足公司应当发行的全部股份，或者募集设立所发行的股份超过招股说明书规定的截止期限尚未募足。
②公司的设立不符合公司法规定的条件。
3、其他原因。
除上述两方面原因外，其他原因也可能导致公司设立无效。例如，公司创立大会本已决议不设立公司。
公司设立的方式基本为两种，即发起设立和募集设立。
1、有限责任公司只能采取发起设立的方式，由全体股东出资设立。
2、股份公司也可以采用发起设立的方式。
3、我国法律规定，股份有限公司可采取发起设立的方式，也可以采取募集设立的方式。
【法律依据】《公司注册资本登记管理规定》第二条规定，有限责任公司的注册资本为在公司登记机关依法登记的全体股东认缴的出资额。
股份有限公司采取发起设立方式设立的，注册资本为在公司登记机关依法登记的全体发起人认购的股本总额。股份有限公司采取募集设立方式设立的，注册资本为在公司登记机关依法登记的实收股本总额。
法律、行政法规以及国务院决定规定公司注册资本实行实缴的，注册资本为股东或者发起人实缴的出资额或者实收股本总额。
根据最新公司法，设立有限责任公司，应当具备下列条件：
（一）股东符合法定人数；
（二）股东出资达到法定资本最低限额；
（三）股东共同制定公司章程；
（四）有公司名称，建立符合有限责任公司要求的组织机构；
（五）有公司住所。
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