离婚时，由法院处理的财产，必须是有合法性的财产，而小产权房，没有完整、合法的审批建设手续，无法取得国家认可的房屋产权证，所以不能在离婚时要求法院分割处理。实践中，法官为了切实帮助当事人解决好财产分割问题，调解时会组织双方协商确定解决方案，比如哪一方所有，参照当地可以转让的同类小产权房的价格给另一方补偿款；或者协商由一方来住，按当地租金标准给另一方一半补偿，如果协商成功，双方私下达成协议，但因为不是合法的产权房，所以不能写进法院的裁决文书里；如果各种方案都协商不成，那法院就不予处理，双方可以自行解决。
虽然《婚姻法解释二》第21条对于尚未取得所有权的房屋应如何处理作出了规定，但该规定是建立在争议房屋有合法来源基础上的，夫妻二人与人签订的房屋买卖协议因违反法律规定而无效，夫妻双方并不具有房屋的所有权，故判决由夫妻一方使用显然不当。其次，如果法院对涉案小产权房进行分割，以裁判文书的形式确认夫妻一方对于小产权房的所有权，势必会干扰国家对农村土地的管理，引起新的纠纷甚至是新一轮离婚潮。正确的做法应是应宣告买卖协议无效，对小产权房不予分割。如此不仅能与法律规定以及国家政策保持一致，还能以案例的形式进行法律宣传，起到在一定程度上禁止小产房买卖的效果。
《婚姻法》第三十九条规定，离婚时，夫妻的共同财产由双方协议处理；协议不成时，由人民法院根据财产的具体情况，照顾子女和女方权益的原则判决。夫或妻在家庭土地承包经营中享有的权益等，应当依法予以保护。
小产权房（别称：乡产权房）是指在农村集体土地上建设的房屋，通常未办理相关证件，也未缴纳土地出让金等费用。 该类房屋的产权证不是由国家房管部门颁发的房产证，而是由乡政府或村政府颁发的集体所有权凭证，因此该类房屋的购房合同在国土房管局无法备案，所谓产权证也不具备法律效力。
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