1、从知道或应当知道权利被侵害时开始计算：
（1）附条件、附期限的请求权，从条件成就、期限到来时起算;
（2）明确履行期限的债权，从期满的次日起算;借款、买卖等合同约定分期履行债务的，诉讼时效从最后一期履行期届满之日起算;
（3）无履行期限的债权，从债权人主张权利时起算，债权人给予对方宽限期的，从宽限期届满之日起算;但债务人在债权人第一次向其主张权利之时明确表示不履行义务的，诉讼时效期间从债务人明确表示不履行义务之日起计算。
（4）以不作为为标的的请求权，从义务人有违反行为之时起算;
（5）因侵权行为发生的请求权，从受害人知道有侵害行为和加害人之时起算;人身损害赔偿的诉讼时效期间，伤害明显的，从受伤害之日起算;伤害当时未发现，后经检查确诊并能证明是由侵害引起的，从伤势确诊之日起算;
（6）国家机关及其工作人员职务侵权赔偿请求权，从国家机关及其工作人员行使职权时的行为被确认为违法之日起算;
（7）海事争议中的诉讼时效期间起算点，依《海商法》的有关规定（参见后附“法条链接”）。
但是在上述各种情形中，如果是从一天中途开始的事实起算（如侵权），因当天不足一天，为保障权利人能够切实行使权利，开始的当天不计算在诉讼时效期间之内;如果是从一天的零时开始（如债务履行期届满的次日），则开始的当天计算在内。
2、从权利被侵害之时起算，只适用于20年的长期诉讼时效。
《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民事诉讼法〉的解释》第二十八条规定，农村土地承包经营合同纠纷、房屋租赁合同纠纷、建设工程施工合同纠纷、政策性房屋买卖合同纠纷，按照不动产纠纷确定管辖。根据民事诉讼法关于地域管辖的规定，因合同纠纷提起的诉讼，由被告住所地或者合同履行地人民法院管辖。因不动产纠纷提起的诉讼，由不动产所在地人民法院管辖。《解释》公布后，关于建设工程施工合同纠纷自然应当由案涉不动产所在地人民法院管辖。
与建设工程施工合同纠纷同属建设工程合同纠纷的并列案由还包括建设工程勘察合同纠纷、建设工程设计合同纠纷、建设工程价款优先受偿权纠纷、建设工程分包合同纠纷、建设工程监理合同纠纷、装饰装修合同纠纷、铁路修建合同纠纷和农村建房施工合同纠纷。从文义解释，上述案由规定中只有符合第四级案由建设工程施工合同纠纷的案件才属于专属管辖，由不动产所在地人民法院管辖。其他并列第四级的案由纠纷，仍然属于合同纠纷，由被告住所地或者合同履行地人民法院管辖，同时可以适用协议管辖和应诉管辖。人民法院在就当事人的诉讼请求确定案由时，应当根据诉讼请求所基于的法律基础确定诉争法律关系，并选择相应的民事案由。
一般的合同纠纷按照民法通则的规定，诉讼时效为二年。几类特殊的争议，如租赁合同中延付或拒付租金的争议，保管合同中寄存物丢失或损毁的争议的诉讼时效为一年。由于合同的复杂性、地域性，因国际货物买卖合同和技术进出口合同争议提起诉讼或者申请仲裁的期限为四年。其他法律规定了特别时效的，依照其规定，如海商法规定的货运赔偿请求权的时效为一年。
诉讼时效的起算时间，自当事人知道或者当应知道其权利受到侵害之日起计算。
合同发生纠纷时，合同当事人或者选择诉讼解决或者选择仲裁机构仲裁，这两者都是通过法律程序解决纠纷的途径。不管是选择诉讼还是选择仲裁，都有一个时效的问题。诉讼或者仲裁时效是权利人请求法院或者仲裁机构解决争议，保护其权益而提起诉讼或者申请仲裁的法定期限。法律规定诉讼时效的目的，在于促使当事人尽早行使权利，尽快解决当事人间的纠纷。
因此根据上述的内容我们可以得知，建设工程合同诉讼时效起算以及建设工程欠款纠纷的处理方式。还在一定程度上介绍了建设工程存在着哪些问题的等相关的知识是怎样运行的。这些都是大家需要了解的知识，若还其他问题需要咨询，欢迎咨询找法网。
