不论是总承包还是分包（转包）工程，结算时都应到工程所在地税务机关开具发票并即时完税。分包（转包）人向总承包人收取分包（转包）工程款时要到当地税务机关开具发票并完税，总承包人向兴建单位收取全额工程款时凭分包（转包）人开出的发票作为分包（转包）工程已完税的依据进行抵减，余额征税。税务机关在开出全额发票时应在发票存根联上注明分包工程开出发票金额和字轨号码。
建筑分包（转包）工程以分包（转包）工程收入额为营业额，由分包（转包）人纳税；总承包人将工程分包或转包他人的，以工程的全部承包额减去付给分包（转包）人的价款后的余额为营业额。不论是总承包还是分包（转包）工程，统一由工程所在地税务机关负责征管。
《营业税暂行条例》第五条规定，纳税人的营业额为纳税人提供应税劳务、转让无形资产或者销售不动产收取的全部价款和价外费用。但是，下列情形除外：
1、纳税人将建筑工程分包给其他单位的，以其取得的全部价款和价外费用扣除其支付给其他单位的分包款后的余额为营业额；
第六条规定，纳税人按照本条例第五条规定扣除有关项目，取得的凭证不符合法律、行政法规或者国务院税务主管部门有关规定的，该项目金额不得扣除。
2、支付给境内单位或者个人的款项，且该单位或者个人发生的行为属于营业税或者增值税征收范围的，以该单位或者个人开具的发票为合法有效凭证。
根据上述规定，总包方将建筑工程分包给分包方，总包方可以其取得的全部价款和价外费用扣除其支付的分包款后的余额作为营业额计缴营业税。总包方应取得分包方开具的发票作为扣除凭证，未取得发票的，不能差额缴税。
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