（1）在承包人完成累计金额达到合同总价一定比例（双方合同约定）后，采用等比率或等额扣款的方式分期抵扣。也可针对工程实际情况具体处理，如有些工程工期较短、造价较低，就无需分期扣还；有些工期较长，如跨年度工程，其预付款的占用时间很长，根据需要可以少扣或不扣。
（2）从未完施工工程尚需的主要材料及构件的价值相当于工程预付款数额时起扣，从每次中间结算工程价款中，按材料及构件比重抵扣工程预付款，至竣工之前全部扣清。其中，起扣点的计算公式如下：
Ｔ＝Ｐ－Ｍ／Ｎ
式中Ｔ——起扣点，即工程预付备料款开始扣回时的累计已完成工程价值；
Ｍ——工程预付款数额；
Ｎ——主要材料及构件所占比重；
Ｐ——承包工程合同总额。
施工企业承包工程，一般实行包工包料，需要有一定数量的备料周转金，由建设单位在开工前拨给施工企业一定数额的预付备料款，构成施工企业为该承包工程储备和准备主要材料、结构件所需的流动资金。
确定工程预付款起扣点的依据是：未完施工工程所需主要材料和构件的费用，等于工程预付款的数额。
1、对业主逾期付款及时主张权利或保存证据。工程款一般分为动员预付款、进度款、结算款，质保金。首先在签订施工合同时，尽管相对甲方，施工方处于不利的地位，但是还是要据理力争，争取在合同中尽可能约定一个对施工方有利的预付款、进度款支付比例。因为，在工程进展过程中，施工单位享有主动权，如果业主建设单位延期付款就可以顺延工期来制约业主，因此应当争取在工程完工前最大限度的争取支付较大数量工程款。再者，在工程进行过程中，一旦业主建设单位出现逾期支付预付款或进度款的情形，不能碍于情面，而不及时提出，应及时提出要求付款的书面申明或索赔申请。这样一是可以在工程索赔程序中获得主动，二是也为将来可能发生的诉讼提供了最充足的证据。再者，对于工程款的支付状况要及时核对，必要是定期和业主建设单位采取财务对账的方式来固定证据。对账的书面单据要加盖双方的印章。这样及时发生了纠纷也可以使得施工企业处于有利地位。
2、充分利用建筑合同有效性问题来确保工程款回收。这个策略的背景是我国严格的建筑资质管理制度与目前建筑市场挂靠借用资质、转包工程普遍存在的矛盾性。由于我国法律认定这些转包、挂靠均属于无效合同。因此，如果签订了这类合同后出现恶意拖欠工程款的现象，施工企业可以针对具体情况要求法院宣告合同无效。因为一旦合同无效，就存在返还工程款的问题，而且施工企业在合同无效后不仅可以要求承包人返还，而且在符合条件的情况下还可以要求法院判决业主建设单位直接对其返还工程款（业主支付后再从其应付承包人的款项中扣除即可）。这样就将资金实力相对雄厚的业主建设单位牵涉进法律关系中来，为分包施工企业获得欠款提供了有利保证。
3、合理合法顺延公司促使工程款支付。在律师接触的工程欠款案件中还普遍存在一个问题：承包人因拖欠工程款提起诉讼，发包人往往以工期逾期为由提出反诉，提出逾期违约赔偿来抵销承包人的诉讼请求。因此，如果出现了逾期付款的问题，施工企业应当充分利用法律赋予承包人的顺延工期的权利。此时，承包人应当及时书面催告发包人在合理期限内履行付款义务（或者委托律师第三方发出律师函以保存发出书面函件的证据）。发包人在合理期限内未履行付款义务，施工企业可以再次发函要求发包人赔偿因此造成的停工、窝工等损失，并告知其相应顺延工期。如果施工企业履行了合法的程序，那么就可以避免因为工程款拖欠后，陷入既要避免垫资施工损失又怕耽误工资导致业主索赔的两难境地。
4、工程垫资应当做好约定确保合法化。施工企业垫资施工是目前建筑市场的一种常见现象。对此，我国法律之前曾命令禁止，但是随着建筑市场的开放，垫资施工逐渐被认可。如果确实需要垫资施工，一是选择垫资的形式，如大型项目根据本律师的经验可采取ＢＯＴ特许经营、ＥＰＣ等交钥匙工程形式来签订协议，这些形式是目前我国法律认可，可以获得法律的保护；二是对于小型工程，一定要明确垫资的数额、支付期限、利息、垫资返还等细节。如果忽视了这些细节，那么垫资一般被法律视为工程欠款，施工企业的其他合法权益就得不到充分的保护。
5、处理好政府工程的审计报告价格与合同价格矛盾。对于政府投资工程需要对工程造价进行审计，因此本律师在办理案件中遇到过业主建设单位要求按照审计报告价格结算工程款的。一般对于这类纠纷，一是可以依据合同的约定，如果合同中约定了工程价格按照政府审计报告结算的，那么应当按照审计价格来计算，据本律师所知，目前大部分规范运行的政府工程都在合同中约定了这个条款，防止发生争议；二是如果合同没有约定按照审计价结算，那么业主建设单位提出按照审计报告结算工程款是违法的，法律不予认可。
第十五条
建筑工程的发包单位与承包单位应当依法订立书面合同，明确双方的权利和义务。发包单位和承包单位应当全面履行合同约定的义务。不按照合同约定履行义务的，依法承担违约责任。
第十六条
建筑工程发包与承包的招标投标活动，应当遵循公开、公正、平等竞争的原则，择优选择承包单位。 建筑工程的招标投标，本法没有规定的，适用有关招标投标法律的规定。
相信大家看了上面的介绍多多少少也应该知道，确定工程预付款起扣点的依据是未完施工工程所需主要材料和构件的费用，等于工程预付款的数额。以上就是找法网小编整理的有关建设工程预付款起扣点怎样算的相关内容，希望能为您提供帮助。
