１、低保户可以的申请廉租房，二个互不冲突。低保是向当地民政部门申请，并需要当地村委会、居委会开具相应的证明。而申请廉租房保障的家庭由户主持下列证件和证明材料向户籍所在地的社区居委会提出书面申请，并携带相关资料，经过初审－公示－审核－然后进行请廉房配租。
２、低保户是可以申请廉租房房的，不过要满足一定的条件，如已经向民政部门连续六个月以上，还有比如家庭成员具有本市非农业常住户口，另外还有一个条件就是家庭人数为两个人或者两个人以上，家庭成员之间有法定的赡养、扶养或者抚养关系的，如果这些条件都符合的，就可以去申请廉租房。
（一）概念不同
廉租房是政府以租金补贴或实物配租的方式，向符合城镇居民最低生活保障标准且住房困难的家庭提供社会保障性质的住房。公租房，即公共租赁房，是对住房困难人群的过渡性的解决方案，旨在为不属于低收入人群但住房困难的人员，提供住房帮助。
（二）分配形式不同
廉租房分为两类，一是由政府出资建好后，低租金给住房困难户，二是由政府发放租金补贴给住房困难户，由他们租赁社会房屋居住。
公租房一般由政府出资建房，低租金租给租户。在租赁５年期满后，符合条件的承租人可以按以综合造价为基准确定的价格购买。购买后可以继承、抵押。
（三）申请对象不同
廉租房主要是针对本市城镇低收入，住房困难家庭。分配对象主要是低保户和一些特定保障对象。
公租房申请对象不受区域和户籍限制。公租房的租赁对象是中低收入阶层，也就是所谓“夹心阶层”，大都是是不受区域限制的。
（四）租金不同
廉租房月租不同地区设有不同的标准，按当地区标准计算
公租房的租金标准按照贷款利息、维护费等因素确定，不超过同类地段、同等品质房屋租金的６０％，并动态调整。
（一）申报家庭收入
租廉租房的家庭，应当如实申报家庭收入。不如实申报的，责令其退房，补交商品房租金和廉租房租金的差价，并处一定金额的罚款。
（二）腾退廉租房
租廉租房的家庭，当家庭收入超过当年最低收入标准时，应当及时报告房地产行政主管部门，并按期腾退廉租房。
（三）不得转租廉租房
租廉租房家庭，不得转租，违者罚款并收回房屋。
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