印花税的纳税方法较其他税种不同，是由纳税人根据税法规定，自行计算应纳税额，自行购买印花税票，自行贴花和画销，自行完成纳税义务。同时，对特殊情形采取特定的纳税贴花方法。
(一)一般纳税方法
印花税通常由纳税人根据规定自行计算应纳税额，购买并一次贴足印花税票，完纳税款。纳税人向税务机关或指定的代售单位购买印花税票，就税务机关来说，印花税票一经售出，国家即取得印花税收入。但就纳税人来说，购买了印花税票，不等于履行了纳税义务。因此，纳税人将印花税票粘贴在应税凭证后，应即行注销，注销标记应与骑缝处相交。所谓骑缝处，是指粘贴的印花税票与凭证之间的交接处。
对国家政策性银行记载资金的账簿，一次贴花数额较大、难以承担的，经当地税务机关核准，可在3年内分次贴足印花。
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(二)简化纳税方法
为简化贴花手续，对那些应纳税额较大或者贴花次数频繁的，税法规定了以下三种简化的缴纳方法
1.以缴款书或完税证代替贴花的方法。
某些应税凭证，如资金账簿、大宗货物的购销合同、建筑工程承包合同等，如果一份凭证的应纳税额数量较大，超过500元，贴用印花税票不方便的，可向当地税务机关申请填写缴款书或者完税证，将其中一联粘贴在凭证上或者由税务机关在凭证上加注完税标记，代替贴花。
2.按期汇总缴纳印花税的方法。
同一种类应纳税凭证若需要频繁贴花的，纳税人可向当地税务机关申请按期汇总缴纳印花税。经税务机关核准发给许可证后，按税务机关确定的限期(最长不超过
1个月)汇总计算纳税。应纳税凭证在加注税务机关指定的汇缴戳记、编号，并装订成册后，纳税人应将缴款书的一联粘附册后，盖章注销，保存备查。
3.代扣税款汇总缴纳的方法。
税务机关为了加强源泉控制管理，可以委托某些代理填开应税凭证的单位(如代办运输、联运的单位)对凭证的当事人应纳的印花税予以代扣，并按期汇总缴纳。
(三)纳税贴花的其他具体规定
纳税人贴花时，必须遵照以下规定办理纳税事宜：
1.在应纳税凭证书立或领受时即行贴花完税，不得延至凭证生效日期贴花。
2.印花税票应粘贴在应纳税凭证上，并由纳税人在每枚税票的骑缝处盖戳注销或画销，严禁揭下重用。
3.已经贴花的凭证，凡修改后所载金额增加的部分，应补贴印花。
4.对已贴花的各类应纳税凭证，纳税人须按规定期限保管，不得私自销毁，以笮税检查。
5.凡多贴印花税票者，不得申请退税或者抵扣。
6.纳税人对凭证不能确定是否应当纳税的，应及时携带凭证，到当地税务机关鉴别。
7.纳税人同税务机关对凭证的性质发生争议的，应检附该凭证报请上一级税务机关核定。
8.纳税人对纳税凭证应妥善保存。凭证的保存期限，凡国家已有明确规定的，按规定办理;其他凭证均应在履行纳税义务完毕后保存1年。
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