协议内容合法就有效。
开发商与购房人签订的《商品房买卖合同》(以下简称《合同》是建设部颁布的格式化文本。购房人还可以对其在购房中就开发商承诺或双方协商一致的内容，以补充协议的方式附在《合同》里，成为《合同》中重要的组成部分。
补充协议应考虑的内容有：包括对房屋质量的约定、对房屋交付流程的约定、对违约责任与解除合同的约定、对产权证取得期限的约定、关于不能如期取得贷款的约定、关于物业的约定等。
实践中，开发商指定的前期物业与业主委员会选聘的物业之间产生的纠纷很多，因此，购房人为保证其入住后权益的维护，也可在《补充协议》中约定物业的有关情况。
总之，购房人应当本着谨慎，宜细不宜粗的原则，审查和签订《合同》或补充协议，对于不清晰和需补充的地方及时同开发商取得联系，从而使自身权益得到最大限度的保护。
当然不是必须的，只不过现在的商品房买卖合同多数都是房管部门的制式合同或者开发商提供的格式合同，补充协议作为合同附件的情况较为常见罢了。
第一，要明确按揭办不下来的话，双方的责任。现在买房通常需要按揭，确实有的情况下按揭没有办下来，没有办下来的原因比较复杂，有购房者的原因，也可能有房地产开发商的原因，甚至也有一些是银行方面的原因，也有一些是综合的。要明确，如果按揭办不下来，双方各自的责任是什么。
第二，明确房屋权证办理的时间。因为购销合同里通常没有说多长时间把产权证办下来，这通常在补充条款里约定。
第三，应该明确的把售楼书和其他广告的内容写进补充协议里去，这是维护购房者合法权益的一个很重要的方式。
第四，明确关于公摊建筑面积。现在面积争议多的就是公用面积的分摊问题，而且有些开发商经常在公摊上做文章，所以要和开发商约定清楚，不仅要有一个笼统的公摊面积的数字，而且要约定公摊的是哪一部分，要确定公摊的位置。现在有很多赠与这个，赠与那个，实际上有的时候是公用的面积。
第五，应该明确装修标准。以后逐渐的房地产开发项目是精装修，那么就必须对装修的标准明确。比如说装修的标准不要笼统的想使用进口材料、高级材料等这种不明确、含糊的表述，一定要明确使用什么品牌，甚至包括颜色等。
第六，明确退房的责任。购房者接到入住通知之后，经常拿出一些资金装修房屋，比如说买家电什么的，但是一旦退房是由于开发商的原因，必须写明开发商是什么样的责任，写名在确定的日期内把开发商退还，甚至包括银行的利息、罚金等。
综上所述，我们知道了商品买卖合同的补充条款内容如果合法，就会有效，当然并不是每一个商品房买卖合同都有补充协议。以上便是找法网小编为您整理的“商品房买卖合同补充条款有效吗”全文。如果您还有关于房地产纠纷方面的疑问，欢迎您到找法网咨询专业律师。
