1、这个需要具体问题具体分析，并不是所有的违章建筑都不能给予拆迁补偿，也就是说建筑违章，但建筑材料是违章建筑人的合法财产，既在拆迁补偿中要注意区分违章建筑和建筑使用的材料。
2、建筑违章但土地具有合法的使用权或产权也要给予适当的补偿，如果因拆迁造成土地使用收益损失应予以适当补偿。
3、在拆迁补偿中，要注意区分违章建筑和建筑内的财产。违章建筑内的财产可以独立于违章建筑存在，系违章建筑人的合法财产，依法应当受到保护。拆迁人在拆除违章建筑的过程中，不得侵犯违章建筑人的违章建筑内的合法财产权益，否则应当承担法律责任。
4、在拆迁补偿中，要注意区分拆迁补偿款和拆迁补助费。
5、在拆迁补偿中，要注意转化的违章建筑的特殊情况。
所谓转化的违章建筑，主要是指因为超过批准期限，由临时建筑转化成的违章建筑。
1、未申请或申请未获得批准；
2、未取得建设用地规划许可证和建设工程规划许可证而建成的建筑；
3、擅自改变建设工程规划许可证的规定建成的建筑；
4、擅自改变使用性质建成的建筑；
5、擅自将临时建筑建设成为永久性的建筑。
根据我国《城市房屋拆迁管理条例》第二十二条规定：拆除违章建筑和超过批准期限的临时建筑，不予补偿；拆除未超过批准期限的临时建筑，应当给予适当补偿。违章建筑人对违章建筑使用的材料享有合法的财产权。因此，拆迁人在拆除违章建筑时依法不给予补偿，并不意味着对拆除违章建筑使用的材料也不给予补偿。
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