１、提交申请，申请人以一种语言，提交一份满足PCT形式要求的国际申请，并缴纳一组费用；
２、国际检索，由“国际检索单位（ISA）”（世界主要专利局之一）检索可影响发明专利性的公开文献，并对发明的可专利性作出意见；
３、国际公布，国际申请中的内容将自最早申请日起18个月届满之后尽早公之于众；
４、补充国际检索（可选），由愿意提供补充检索且未参与主检索的国际检索单位执行，查找进行主检索的国际检索单位因现有技术在语言和技术领域上的多样性而未能检索到的已公布文献；
５、国际初步审查（可选），经申请人要求，国际公布后（通常是在对原申请做出修改的情况下），由一国际检索单位进行附加的专利性分析；
６、国家阶段。PCT程序完成之后，申请人开始直接向希望获得专利的国家（或地区）专利局寻求专利授予；
外国提出普通专利申请时，专利申请人必须在首次提交专利申请之日后的十二个月内向每一个国家的专利局提交专利申请。而通过PCT，专利申请人可以在首次提交专利申请之后的二十个月内办理国际专利申请进入每一个国家的手续；如果要求了国际初步审查，还可以在首次提交专利申请之日后的三十个月内办理国际专利申请进入每一个国家的手续。这样便延长了进入国家阶段的时间。利用这段时间，专利申请人可以对市场、对发明的商业前景以及其他因素进行调查，在花费较大资金进入国家阶段之前，决定是否继续申请外国专利。若经过调查，决定不向外国申请专利，则可以节省费用。
国际专利申请的语言可以是中文、英语、法语、德语、日语、俄语、西班牙语等。中国申请人提出国际专利申请可以使用中文和英文，这为中国的外资企业申请专利提供了方便。
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