法律中规定当事人可以选择司法保护或行政保护，其中司法保护就是直接向人民法院提起诉讼，找法网小编为您整理的有关法院专利侵权怎么索赔的内容如下：
一、专利侵权如何救济？
当专利权受到侵害时，有两个选择：到人民法院起诉或者请求专利局进行处理。
选择司法保护和行政保护之前，应先明白两者之间的差异：
１、专利管理机关在处理专利侵权时，虽然有权责令侵权人停止侵权行为，并赔偿损失，但这种处理不是终局的，只要当事人有一方不服的（可能是专利权人，也可能是被控侵权人），他在收到专利局的处理通知之日起三个月内，可以向法院起诉。只有当双方当事人对专利局的处理决定表示接受或者在规定的起诉期间内没有到法院起诉，该处理决定才算具有法律效力；法院对专利侵权的判决是终局的，其他任何机关不能改变这种判决。
２、专利局的救济手段有限，只能责令侵权人停止侵权和赔偿损失；而法院可以行使《民法通则》规定的一切民事救济手段。
３、行政处理具有主动性的优势，简便、快捷、高效；而法院则实行“不告不理”，当事人必须做好充分的诉前准备，否则将会面临证据不足的尴尬。
二、专利侵权赔偿怎么计算？
损害赔偿，我国理论上一般的概念是“指当事人一方因侵权行为或不履行债务而对他方造成损害时应承担补偿对方损失的民事责任。对权利人来说，损害赔偿是一种重要的保护民事权利的手段，对义务人来说，它是一种重要的承担民事责任的方式”。这一概念揭示了损害赔偿的补偿性功能和财产责任形式。
１、最高人民法院在《关于审理专利纠纷案件若干问题的解答》中，就专利侵权的损害赔偿问题提出了三种计算方法：
（１）以专利权人因侵权行为受到的实际经济损失作为损失赔偿额。计算方法是：因侵权人的侵权产品（包括使用他人专利方法生产的产品）在市场上销售侵使专利权人的专利产品的销售量下降，其销售量减少的总数乘以每件专利产品的利润所得之积，即为专利权人的实际经济损失。
（２）以侵权人因侵权行为获得的全部利润作为损失赔偿额。计算方法是：侵权人从每件侵权产品（包括使用他人专利方法生产的产品）获得的利润乘以在市场上销售的总数所得之积，即为侵权人所得的全部利润。
（３）以不低于专利许可使用费的合理数额作为损失赔偿额。
对于上述三种计算方法，人民法院可以根据案情的不同情况选择适用。
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