一、申请的形式
为降低申请费用，欧洲专利申请通常在线提交。为避免申请时内容出现差异，建议将申请文件的图形文件(PDF格式)提供给欧洲的专利代理人。据此，可以向欧洲专利局提交该图形文件的申请。
另外，从排版文件(WORD格式)电子转换的图形文件，有时可能也会出现问题，如希腊字母等特殊文字等。
因此，在欧洲提交专利申请时，最好将排版文件打印后扫描的图形文件提供给欧州的专利代理人。除此之外，为了在申请时或者申请后能够更容易地修改权利要求及说明书，最好能提供排版文件原件。
二、申请检索结果的复印件
申请日为2011年1月1日以后的直接向欧洲提交的专利申请、PCT国际专利申请以及分案申请，还需要对主张优先权的申请提交与美国类似的检索结果的复印件。如果没有提交，审查员在审查时，可以要求在2个月期限内提交;如果不答复，该申请将被视为撤回。
三、国际申请进入欧洲阶段后的答复
以欧洲专利局以外的专利局为国际检索单位或国际初审单位时，在进入欧洲阶段后，欧洲专利局会撰写补充检索报告，其中包括与审查报告相同的意见书。
四、非欧洲专利局的通用语言如何解决
欧洲专利局的通用语言为德语、英语或法语，如果提交专利申请的语言不是这些通用语言时，必须提交翻译后的文件。
五、分案申请
提交分案申请的原则是，母案申请仍在审查中。母案申请授权时，至欧洲专利局授权公报发布的前一日，仍可以提交分案申请。另一方面，母案申请被驳回时，至书面驳回通知作出之日起2个月的最后一日也可以提交分案申请。如果请求复审，则在复审阶段可以提交分案申请。
六、指定发明人
PCT国际申请在进入欧洲阶段时，不需要指定发明人。但是，包括分案申请的其他全部申请则需要指定发明人。该指定无需支付附加费。指定发明人时需要提供下述信息：发明人的姓名;发明人的邮寄地址等。
