当前我国处于加快结构调整和经济转型升级的关键时期，对于专利权保护的需求与日俱增，这正是加强专利行政执法职能的初衷。笔者建议，加强专利权的行政保护，应赋予行政机关更多的职权来处理专利纠纷，如增加带有司法性质的调查取证权，对侵权赔偿额的判定权等。
追根溯源，任何一种权力的本质都是基于社会利益的需求。面对专利权纠纷的专业化、技术化，纠纷类型多样化的趋势，依靠法院处理专利权纠纷的传统体系已不能满足社会发展的需求，这是专利行政执法行为的正当性基础。行政执法行为的出现，并不会改变司法权的本质，不会动摇原本的权力分工。行政机关做出一些具有判断力的行为，并不会影响司法权应有的效力，这是专利行政执法行为的合法性基础。
当前，创新驱动在社会进步中优势突出，人们越发意识到维护创新成果的重要性，而企业也更重视公司的专利战略布局，通过加强对专利权的保护来维持自己的竞争优势。但是，专利纠纷不同于普通的民事纠纷，具有较强的专业性、技术性，尤其在侵权判定上不像普通民事案件那样一目了然，法院在处理这类纠纷时难免耗费更多的时间和资源。而专利行政管理部门熟悉与专利相关的法律法规，了解专利侵权的表现形式，无论在调查取证，还是专利侵权的判定上都具有明显的优势。因此，进一步加强对专利权的行政保护十分必要。
在调查取证上，专利侵权的侵权证据往往由侵权人掌控，被侵权人在维权过程中常常举步维艰。笔者建议，应增加专利管理部门对专利侵权案件的调查取证手段，并明确被调查的当事人拒绝、阻挠专利管理部门行使职权的，由专利管理部门予以警告；情节严重的，依法给予治安管理处罚。此举有助于解决被侵权人维权没有证据的问题，更好地维护专利权人的合法权益，也鼓励其在受到侵权损害时积极维护自己的权利。
此外，专利管理部门也需要对专利侵权的赔偿额进行判定，可根据专利权的类型、侵权行为的性质和情节等因素，确定给予1万元以上100万元以下的赔偿。这将使一些显而易见的赔偿纠纷没必要再诉到法院，减少法院负担，节约资源。对于当事人来说，这更是有利于纠纷及早解决的有效方式。
