1、转让专利收入需要按转让无形资产税目缴纳营业税、城建税与教育费附加。2、同时按转让专利收入扣除相关税收、费用后，按特许权使用费所得税目缴纳20%个人所得税。收入扣除缴纳的相关税金(营业税、城建税、教育费附加)后，区别不同收入分别处理：(1)不到4000元的，扣除费用800元：应纳税所得=收入-800元(2)收入超过4000元的，扣除20%的费用应纳税所得=收入*(1-20%)(3)应纳税款=应纳税所得*20%。
专利许可合同不是必须要备案的。
【法律依据】
《中华人民共和国专利法》第十二条，任何单位或者个人实施他人专利的，应当与专利权人订立实施许可合同，向专利权人支付专利使用费。被许可人无权允许合同规定以外的任何单位或者个人实施该专利。
1、主体资格审查：合同双方应对合同对方的资产状况、信誉状况以及是否有签订此类合同的合法的主体资格等作调研。
2、双方应弄清合同的性质，合理界定双方的权利和义务。
3、当事人应当明确约定对专利技术的验收采取何种方式，可以约定采用鉴定会、专家评估，也可以约定以被许可方认可视为验收通过。
4、专利技术水平较高，专业性较强，因此，在签订合同时，合同用语一定要准确、清楚，对一些关键性的名词术语要作出必要的定义或解释，以免发生歧义。合同条款表述一定要完整、规范。
5、当事人应当明确约定专利实施许可应当提交专利说明书和权项保护范围中所涉及的全部技术内容，包括工艺设计、技术报告、工艺配方、文件图纸等有关内容。
6、合同只要有违反合同约定金或赔偿损失的，就要约定具体数额或计算方法。在约定违反合同约定金时，数额约定不能过高或过低，约定数额过低，损失得不到补偿，约定数额过高，会因数额过高得不到法律支持无法实现。一般而言，约定的违反合同约定金数额不能超出合同标的额，若一方的损失确实超过合同标的，可直接约定赔偿损失。
7、双方应在合同中约定，合同未尽事宜依照有关法律法规执行，法律法规未作规定的，双方可另行协商签订书面补充协议作为本合同的附件，补充协议与本合同具有同等法律效力。
8、双方当事人应明确合同标的采用何种物质载体(如图纸、文件资料、磁盘等)。
9、当事人应当约定专利技术达到上述指标的依据及评价办法，如是以行业标准、专家鉴定还是其他方式做依据和评价标准。当事人应明确约定履行的地点或可确定履行地点的可操作性办法。
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