1.定义不同
商标权简单来说的话就是你拥有商标的该有的权利。商标所有人可以在生产、加工、制造等地方利用商标。
版权又称著作权，版权是指公民、法人和其他组织对其创作的文学、艺术和科学领域内的作品依法享有的权利。
2.申请机构不同
商标是通过商标局进行申请的，而版权是通过中国版权登记中心进行登记的。
3.保护对象不同
我国商标权的获得必须履行商标注册程序，而且实行申请在先的原则。《中华人民共和国商标法》规定，经商标局核准注册的商标为注册商标，商标注册人享有商标专用权，受法律保护。
而著作权一般是自动产生，并不需要经过某些特别程序，根据《中华人民共和国著作权法》的规定，我国的公民和法人以及非法人组织是以作品的完成为著作权产生的标志而不是发表时。
4.保护期限不同
保护的期限也不同。商标的期限只有10年有限期，超过10年需要进行商标续展。而版权进行登记之后，保护期为作者终生及死后50年。
5.客体不同
商标是区别同一商品或者服务的不同经营者并表明商品或者服务质量的商标标识本身。而版权却是针对文字、音乐、艺术、科学创作等原创的保护。
商标是一个专门的法律术语。品牌或品牌的一部分在政府有关部门依法注册后，称为“商标”。商标受法律的保护，注册者有专用权。国际市场上著名的商标，往往在许多国家注册。中国有“注册商标”与“未注册商标”之区别。注册商标是在政府有关部门注册后受法律保护的商标，未注册商标则不受商标法律的保护
版权，亦称“著作权”，指作者或其他人（包括法人）依法对某一著作物享受的权利。
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