员工违反保密协议，泄露公司商业秘密，给公司造成损失的，可以要求员工赔偿损失，员工不赔付的，可以申请劳动仲裁。如果构成犯罪的，向公安机关报案。
《中华人民共和国劳动合同法》第二十三条 【保密义务和竞业限制】用人单位与劳动者可以在劳动合同中约定保守用人单位的商业秘密和与知识产权相关的保密事项。
对负有保密义务的劳动者，用人单位可以在劳动合同或者保密协议中与劳动者约定竞业限制条款，并约定在解除或者终止劳动合同后，在竞业限制期限内按月给予劳动者经济补偿。劳动者违反竞业限制约定的，应当按照约定向用人单位支付违约金。
第二十四条 【竞业限制的范围和期限】竞业限制的人员限于用人单位的高级管理人员、高级技术人员和其他负有保密义务的人员。竞业限制的范围、地域、期限由用人单位与劳动者约定，竞业限制的约定不得违反法律、法规的规定。
在解除或者终止劳动合同后，前款规定的人员到与本单位生产或者经营同类产品、从事同类业务的有竞争关系的其他用人单位，或者自己开业生产或者经营同类产品、从事同类业务的竞业限制期限，不得超过二年。
第九十条 【劳动者的赔偿责任】劳动者违反本法规定解除劳动合同，或者违反劳动合同中约定的保密义务或者竞业限制，给用人单位造成损失的，应当承担赔偿责任。
1、加强企业对商业秘密的保护意识
企业高层领导及HR首先要意识到保护商业秘密的必要性，视其为企业的“杀手锏”，认真剖析国内外企业管理商业秘密的成功经验和被窃取秘密造成巨大经济损失的案例，总结经验教训，形成符合自身特点的保护管理模式；其次重视对员工的保密教育，组织保守企业商业秘密的专项学习培训，反复强调、宣传保密的重要性，同时向员工发放适宜公开的《保密手册》，减少人员流动所带来的泄密风险。
2、建立企业商业秘密保护机构
企业商业秘密的认定与保护工作本身有着较高的法律性和技术性的特点，需要有专门的机构和人员开展这项工作，故，有条件的企业可以设立商业秘密保护机构，配备专业的保密人员。
3、建立严格的保密规章和管理制度
企业应根据自身的实际情况建立严格的保密规章制度，并且做好公示，确保员工能明确知晓保密信息的存在，以及违反保密制度的所承担的法律责任。同时，尽量缩小人员的涉密范围，引入相互牵制制度，对部分重大核心秘密进行分解，使每一涉密员工只能接触到秘密的一部分。
不但如此，还可以做一些物理性防范措施，例如将载有商业秘密的文件和档案加盖保密章，施行专人、专库、专柜制度，规范涉密文件的借阅手续。对涉密的生产设备和生产过程安排在特定区域内进行，对设备的保密部分用箱体封闭，同时标注“保密”标识。
4、签订保密协议或者竞业限制协议
与员工签订保密协议，或者在劳动合同中设立详细的保密条款。保密协议可以对保密的内容和范围、保密协议双方的权利义务、保密期限及赔偿责任等做出约定，不仅可以规范员工的日常行为，也是要求泄密员工承担赔偿责任的依据。对于涉密性较强的员工，企业还可以与其签订竞业限制协议，要求竞业限制人员在离职后一定期限内未经同意不得从事与本单位相同或者相类似的业务，从根本上阻断泄密渠道。
商业秘密的损失计算一般有以下两种方式：
一是以商业秘密权利人因侵权行为遭受的损失作为定罪量刑和实际赔偿的依据。商业秘密权利人可计算的财产、收入方面的损失应全部作为损失的数额。这里既包括权利人本身的收入，也包括权利人预期的若干年内收益。主要考虑的因素有：商业秘密的开发投入、商业秘密的成熟程度、商业秘密的利用周期及其是否可以重复利用，以及商业秘密的使用和转让、市场的供求状况等。
二是以侵权人因侵权行为获得的利益作为损失和赔偿额。这种损失的计算以侵权人未再向第三人披露、转让和不为其他公众所知为前提。对于非法将商业秘密出卖给他人的，以其非法出卖收入为损失额;违法使用商业秘密进行生产经营活动的，以其因此获得或增加的利润为损失额。
司法实践中，商业秘密权利人的损失往往难以计算，法院通常以侵权人所获得的利润作为裁判的依据。在计算侵权人在侵权期间因侵权所获得的利润时，不能简单地以销售额为获利额，也不能以已生产的产品的价格总额乘以平均利润率为获利额，一般情况下，以销售额乘以平均利润率为获利额较为妥当。
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