１、概念不同
商业秘密，是指不为公众所知悉，能为权利人带来经济利益，具有实用性并经权利人采取保密措施的技术信息和经营信息。商业秘密的＂不为公众所知悉＂即只要不是在本行业内众所周知的普通信息，能够与普通信息保持最低的秘密或新颖限度的差异的信息，都构成商业秘密。
专利是一项发明创造，即发明、实用新型或外观设计向国家专利局提出专利申请，经依法审查合格后，向专利申请人授予的在规定的时间内对该项发明创造享有的专有权。
２、构成要件不同
商业秘密得满足构成要件才行，非公知性，实用性，价值性，采取了保密措施，这些要件缺一不可。是有可能成为商业秘密的，就看是否满足上述四个要件。
而专利则是根据申请人的申请来确定，授予专利权的发明和实用新型，应当具备新颖性、创造性和实用性。
３、实施的困难程度不同
商业秘密的实施难度要大于专利。
商业秘密是一种特殊的知识产权。《中华人民共和国刑法》第219条规定：所谓商业秘密，是指不为公众所知悉，能为权利人带来经济利益，具有实用性并经权利人采取保密措施的技术信息和经营信息。商业秘密的＂不为公众所知悉＂即只要不是在本行业内众所周知的普通信息，能够与普通信息保持最低的秘密或新颖限度的差异的信息，都构成商业秘密。
而专利是一项发明创造，即发明、实用新型或外观设计向国家专利局提出专利申请，经依法审查合格后，向专利申请人授予的在规定的时间内对该项发明创造享有的专有权。
一是以优厚的待遇来保护商业秘密。即对接触、使用企业商业秘密的职工，特别是高级管理人员给予较优厚的工资、奖金、津贴待遇，同时在劳动合同中写明，一旦享受特殊津贴，则应负有相应的保密义务。
二是以劳动合同长期化来保护商业秘密。在职员流动比较普遍的今天，这一方法更具有重要作用。劳动合同长期化，可以使关键岗位（接触、掌握商业秘密）的职工，由于收益长期性的预期而留在岗位上。
三是以吸纳股东来保护商业秘密。即允许商业秘密的发明人，接触、掌握商业秘密的人拥有部分股权，成为企业的股东，使之与企业形成休戚相关的命运共同体。日本许多中小企业对掌握和从事关键技术和工艺的职工，往往终身雇佣，或直接吸纳为企业的股东，其用意是既防止人才流失，又防止商业秘密外泄。我国某些高新技术企业已开始了这方面尝试。
相关法律依据：
《反不正当竞争法》第十条规定，经营者不得采用下列手段侵犯商业秘密：
（１）以盗窃、利诱、胁迫或者其他不正当手段获取权利人的商业秘密；
（２）披露、使用或者允许他人使用以前项手段获取的权利人的商业秘密；
（３）违反约定或者违反权利人有关保守商业秘密的要求，披露、使用或者允许他人使用其所掌握的商业秘密。
第三人明知或者应知前款所列违法行为，获取、使用或者披露他人的商业秘密，视为侵犯商业秘密。
本条所称的商业秘密，是指不为公众所知悉、能为权利人带来经济利益、具有实用性并经权利人采取保密措施的技术信息和经营信息。
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