(一)如何认定被告人主观明知的证据运用
主观方面是人的内在心里活动过程，很难用外在的标准去衡量，往往被告人也拒不承认自己“明知”，也不承认有“贩卖的目的”。明知，包括其知道、认识到、意识到或者怀疑到“可能”是毒品，更不要求确切的知道是哪种毒品。有的被告人虽声称不知道是毒品，但根据其社会经历、认识能力、毒品的藏入方法、交易价格、联络方式、被查获时的言行表现、同伙的证言等方面综合分析判断，得出应当明知是毒品的结论。
(二)对被告人不认罪的案件的证据应用
1、购毒人陈述详尽真实，多次供述一致，又有证人的证言能相互印证的，可以定案。购毒人的证言相对客观，比较真实可信，若能与其他证人的证言相互印证，可以认定被告人有罪。这类证人的证据要求是直接证据，而不是从其他人听到的事实或者是转述的事实，必须是目击证人，或者是共同吸食毒品的现场证人，能亲眼指认出被告人，这种证人证言有相当的证明力，与购毒人陈述结合起来，可以认定被告人有罪。
2、被告人拒不供述。有多名购毒人员的供述一致，均能指认从某被告人手中购买毒品的事实，详细交代了购买毒品的地点、时间、过程和情节的，某些细节供述一致，排除了非法证据，可以认定被告人有罪。还可以结合被告人有无犯罪前科，有无吸贩经历，以及“粉友”提供的事实情况来分析。从每一起毒品交易来说，没有确实充分的证据来证明，但从一个整体来讲，被告人有一贯的、长期的贩卖毒品的行为，并且经其他贩毒人员指认的，认定其有罪是符合证据规则的，如果多名购毒人员的陈述简单粗略，不能相互印证，则不能定案。
3、在交易过程中被当场抓获，被告人拒不供述的，只要购毒人客观真实的供述交易过程，联系方式，有抓获人员亲自目睹交易过程的，可以认定定罪，如有的案件是在公安机关诱惑侦查的情况下人赃俱获。搜查到了毒资和毒品，提取了通讯记录，只要这些证据客观真实，即使被告人拒供也应当定罪处罚。
4、有多个被告人的案件中，多数被告人做了供述，有少数被告人始终不作供述，而多数被告人的供述之间有主要情节吻合，是比较有力的证实，是可以认定的。
5、买卖双方不是同时在现场抓获，只有一方被告人供述，另一方拒不供述，又无法获得其他旁证材料印证，形成一对一证据，是孤证，在这种情况下，不能认定被告人有罪。
