刑事案件办案程序要经过侦查机关(公安机关、检察院反贪局)侦查阶段、检察院审查起诉阶段、法院的审判阶段这三个实体程序。
1、侦查机关的侦查阶段：侦查机关(公安机关、检察院反贪局)在这个阶段的职责就是收集证据来证明犯罪的成立。期限要求：从犯罪嫌疑人逮捕起算侦查期限2个月。一般案件都可以在这个期限内侦查结束。如果在这个期限内不能完成侦查，根据刑事诉讼法的相关规定，在具备延长条件和办理相关手续后还可以再延长三次期限，第一次可以延长1个月，第二次可以延长2个月，第三次可以延长2个月。侦查机关从一个犯罪嫌疑人被刑事拘留开始侦查到侦查阶段结束，最长办案时间是8月零7天。
2、检察院审查起诉阶段：侦查机关在收集证据后，要把案件的材料移交检察院。检察院在这个阶段要审查案件的事实是否清楚，定性是否准确，证据是否充分，是否符合起诉条件。期限要求：一个月，可以延长半个月，一般的案件在一个半月的期限内可以审查完毕。如果检察院在审查中认为案件存在问题，可以提出补充侦查。补充侦查仅限两次，每次一个月。每次补充侦查后重新计算期限。检察院审查起诉最长期限六个半月。
3、法院的审判阶段：检察院认为案件符合起诉条件，要把案件移交法院审判。法院在这个阶段的职责就是从事实、定性、证据来判断检察院起诉指控的案件是否成立，并根据不同情况作出判决。期限要求：法院审理公诉案件应当在受理后一个月以内宣判，至迟不得超过一个半月。有些特殊案件经过批准，可以再延长一个月。一般案件在两个半月能够审结。特殊情况：当事人和辩护人申请通知新的证人到庭，调取新的证据，申请重新鉴定或者勘验的，审判人员根据具体情况，认为可能影响案件事实认定的，应当同意该申请，并宣布延期审理，延期审理的时间不得超过一个月，延期审理的时间不计入审限。在这种情况下法院应当在三个半月的审限内审结案件。
公安机关对于现行犯或者重大嫌疑分子可以刑事拘留。对于被拘留的人，应当在拘留后的24小时以内进行讯问。犯罪嫌疑人在被侦查机关第一次讯问后或者采取强制措施之日起，可以聘请律师为其提供法律咨询、代理申诉、控告。受委托的律师有权向侦查机关了解犯罪嫌疑人涉嫌的罪名，可以会见在押的犯罪嫌疑人，向犯罪嫌疑人了解有关的案件情况。
人民检察院审查案件，应当讯问犯罪嫌疑人，听取被害人和犯罪嫌疑人、被害人委托的人的意见。
公诉案件自案件移送审查起诉之日起，犯罪嫌疑人有权委托辩护人。自诉案件的被告人有权随时委托辩护人。人民检察院自收到移送审查起诉的案件材料之日起三日以内，应当告知犯罪嫌疑人有权委托辩护人。人民法院自受理自诉案件之日起三日以内，应当告知被告人有权委托辩护人。
人民法院对提起公诉的案件进行审查后，对于起诉书中有明确的指控犯罪事实并且附有证据目录、证人名单和主要证据复印件或者照片的，应当决定开庭审判。除涉及国家秘密或者个人隐私的案件，人民法院审判第一审案件应当公开进行。
辩护律师自人民法院受理案件之日起，可以查阅、摘抄、复制本案所指控的犯罪事实的材料，可以同在押的被告人会见和通信。开庭审理时，辩护律师为被告人辩护。
《刑事诉讼法》第六十一条
人民法院、人民检察院和公安机关应当保障证人及其近亲属的安全。对证人及其近亲属进行威胁、侮辱、殴打或者打击报复，构成犯罪的，依法追究刑事责任；尚不够刑事处罚的，依法给予治安管理处罚。
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