根据法律的规定和司法实践，主要在管理的机关，承担的司法任务，关押的人员，适用的情形，关押的期限等方面有区别，具体的区别如下：
看守所是羁押依法被逮捕、刑事拘留的人犯的机关。看守所的任务是依据国家法律对被羁押的人犯实行武装警戒看守，保障安全;保障安全;对人犯进行教育;管理人犯的生活和卫生;保障侦查、起诉和审判工作的顺利进行。 被判处有期徒刑一年以下，或者余刑在一年以下，不便送往劳动改造场所执行的罪犯，也可以由看守所监管。看守所是个中转站，法院审判、定刑之前，犯人所暂时关押的地方。正常情况下，有个法定期限，被拘押者在看守所只做短暂停留———要么很快释放，要么很快判刑转往监狱服刑了。 看守所是各级公安机关(含国家安全机关)依法设立的临时羁押犯罪嫌疑人、被告人的场所。 它的职责是担负对犯罪嫌疑人、被告人的看管教育工作，并执行剩余刑期不满一年的罪犯的刑罚，和执行被判处拘役罪犯的刑罚。 它的主管机关是相应的公安机关。 人民检察院在看守所均设有派驻机构，专门进行法律监督。
拘留所是依据现行的法律、法规、条例和相关规定而设置的羁押场所，由公安部门统一负责管理，拘留所是依据全国人大常委会通过的《治安管理处罚条例》的规定设置。 拘留所羁押的是受行政拘留处罚的人，所以拘留所是国家行政羁押机关。拘留所羁押的对象是治安拘留的人以及法院决定司法拘留的人。拘留所最多只能拘留15天。
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