根据最高人民法院《关于审理未成年人刑事案件具体应用法律若干问题的解释》的规定：对未成年人罪犯适用刑罚，应当充分考虑是否有利于未成年人罪犯的教育和矫正。并应充分考虑其实施犯罪的目的和动机，以及犯罪的年龄、是否是初犯、悔罪表现、成长经历等因素。具体分析如下：
(一) 把握全案整体和个案的区别，不能“一刀切”
1、 对未成年人的强奸案要有整体把握，即实行“教育、感化、挽救”的方针，坚持“教育为主，惩罚为辅”的原则，在量刑上，应当从轻或减轻处罚。
2、 以暴力、胁迫或其他手段强奸妇女的，构成强奸罪，处三年以上十年以下有期徒刑。
3、 强奸妇女、奸淫幼女，有下列情形之一的，处十年以上有期徒刑、无期徒刑或死刑：
(1) 强奸妇女、奸淫幼女情节恶劣的; (2) 强奸妇女、奸淫幼女多人的;( 3) 在公共场所当众强奸妇女的; (4) 二人以上轮奸的; (5) 致使被害人重伤、死亡或造成其他严重后果的;
4、奸淫不满十四周岁幼女的，从重处罚。
(二) 法定情节和酌定情节的适用情况
未成年人强奸案件应当依法考虑的法定情节有初犯、自首、立功、从犯、胁从犯、未遂、预备犯、中止犯等。应当将法定情节作为确定量刑幅度的主要依据，再考虑酌定情节。既不能将法定情节作为唯一的量刑标准，忽视酌定情节，也不能强化酌定情节而弱化法定情节，应该把二者有机结合起来，终合考虑。
(三)根据最高人民法院出台的《关于审理未成年人刑事案件具体应用法律若干问题的解释》第六条规定：“已满十四周岁未满十六周岁的人偶尔与幼女发生性行为，情节轻微、未造成严重后果的，不认为是犯罪。”未成年人犯强奸罪如何处罚，应该从以下几方面分析：
1、针对的犯罪主体是已满十四周岁未满十六周岁的未成年人。
2、衡量一个人的行为是否犯罪，要同时构成三个要件，即社会危害性、刑事违法性、刑法当罚性。如双方是恋人关系或其他关系发生了性行为，没有强迫，完全是出于自愿，对于这样的越轨行为，我们只能通过道德手段加以纠正。
3、必须是偶尔、而且是情节轻微、未造成严重后果。解释使用的“偶尔、情节轻微、未造成严重后果”是给司法机关的自由裁量权留有一定的空间。
相关知识延伸阅读：强奸罪是如何规定的
(1)强奸罪的本质：违背妇女意志、强行发生非法的性关系;
刑法保护的是妇女的性自由?还是妇女的贞操权? 我国的强奸罪保护的是性自主权;
(2)犯罪对象，妇女，不满十四周岁的幼女(合奸幼女必须非雏妓)。强奸尸体不够成强奸罪，应构成侮辱尸体罪;
(3)行为方式：“暴力、胁迫或其他手段”的理解：达到致使被害妇女不能、不敢、不知反抗的状态;暴力、胁迫手段必须达到使妇女明显难以反抗的程度;其他手段：趁被害妇女熟睡、重病、晕倒;冒充被害妇女的丈夫、情人迷奸;
(4)违背妇女意志的理解：必须行为人认识到妇女不同意，且被害妇女确实不同意，两个条件缺少一个，就不成立。
(5) 犯罪主体：丈夫可否构成本罪，目前在中国，丈夫一般不能构成强奸，因为当中涉及到我国文化历史等问题，另一方面如果承认了丈夫可以成为强奸的直接正犯，这会涉及到了妻子的无限正当防卫权的问题，故现阶段不宜把丈夫列为强奸妻子的直接正犯，但是丈夫可以通过间接正犯或者共犯的方式构成强奸妻子的强奸罪。
