犯本条所规定之罪的，处五年以下有期徒刑、拘役、管制或者剥夺政治权利；情节严重的，处五年以上十年以下有期徒刑或者无期徒刑。情节严重一般是指担任重要职务的人叛逃的，携带国家秘密叛逃的，叛逃后发表有损中华人民共和国的言论的，等等。
掌握国家秘密的国家工作人员犯本罪的，依照上述规定从重处罚。
根据《刑法》第56条和第113条的规定，犯本罪的，应当附加剥夺政治权利，可以并处没收财产。
犯本条所规定之罪的，处五年以下有期徒刑、拘役、管制或者剥夺政治权利；情节严重的，处五年以上十年以下有期徒刑或者无期徒刑。情节严重一般是指担任重要职务的人叛逃的，携带国家秘密叛逃的，叛逃后发表有损中华人民共和国的言论的，等等。
掌握国家秘密的国家工作人员犯本罪的，依照上述规定从重处罚。
根据《中华人民共和国刑法》第５６条和第１１３条的规定，犯本罪的，应当附加剥夺政治权利，可以并处没收财产。
1、叛逃罪与背叛国家罪的区别
叛逃罪表现为叛逃境外或在境外叛逃，也具有背叛祖国的性质，但是叛逃罪与背叛国家罪有很大的区别，主要表现在：第一，犯罪主体不同。本罪的主体必须是国家机关工作人员；而背叛国家罪的主体只要是跨国公民即可。第二，在客观方面有所不同。本罪的客观行为表现为在履行公务期间叛逃境外或者在境外叛逃，危害中华人民共和国国家安全和行为；而背叛国家罪则表现为勾结外国，危害中华人民共和国的主权、领土完整和安全的行为。
2、叛逃罪与军人叛逃罪的区别
主体不同。一个是国家机关工作人员；一个是军人。
3、叛逃罪与偷越国（边）境的区别
犯罪目的不同，主体身份不同。犯叛逃罪与偷越国（边）境的，属于吸收犯。
4、叛逃罪与投敌叛变罪的区别
所谓投敌叛变罪，是指投奔敌人营垒并为其效劳，或者在被捕、被俘后，投降敌人的行为。投敌叛变罪、叛逃罪都具有背叛祖国的性质，但是二者却有本质的区别，主要表现在：第一，犯罪主体不同。本罪只能是国家机关工作人员；而投敌叛变罪的主体是中国公民。第二，在客观方面不同。本罪表现为在履行公务期间，叛逃境外或者在境外叛逃的行为；投敌叛变罪则表现为投奔敌人营垒或者投降敌人的行为。二者区别的关键是本罪只是叛逃到境外，却不是投靠敌人；而投敌叛变罪则主要是投靠敌人，并有变节行为，却不一定是投奔境外的敌人。
《刑法》第五十六条【剥夺政治权利的适用对象】对于危害国家安全的犯罪分子应当附加剥夺政治权利；对于故意杀人、强奸、放火、爆炸、投毒、抢劫等严重破坏社会秩序的犯罪分子，可以附加剥夺政治权利。
独立适用剥夺政治权利的，依照本法分则的规定。
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