认定本罪，应注意以下两个问题：
1．本罪与非罪行为的界限
根据刑法第383条第1款第4项的规定，构成贪污罪的数额起点原则上为5000元。如果贪污的公共财物数额虽然没有达到5000元，但是情节严重的，如多次贪污屡教不改、贪污救灾、救济、扶贫款或者贪污公共财物用于非法活动的等，也应该以贪污罪论处。如果贪污的公共财物数额不满5000元，并且情节较轻的，由其所在单位或者上级主管机关酌情给予行政处分。
2．本罪与盗窃罪、诈骗罪、侵占罪的界限
贪污罪与盗窃罪、诈骗罪、侵占罪的主要区别是：（1）犯罪主体不同。即前者是特殊主体，而后者是一般主体。（2）犯罪的客观方面不同。是否利用职务上的便利，侵吞、盗窃、骗取公共财物，是区分贪污罪与盗窃罪、诈骗罪、侵占罪的关键。（3）犯罪客体不同。即前者侵犯的是复杂客体；后者则仅侵犯了公私财产所有权。
3．本罪与职务侵占罪的界限
本罪与职务侵占罪在主观上都是故意犯罪，并且都以非法占有为目的；在客观上都以利用职务上的便利为必备要件。二者的主要区别是：（1）犯罪主体不同。前者的主体是国家工作人员以及受国家机关、国有公司、企业、事业单位、人民团体委托管理、经营国有财产的人员，后者的主体是公司、企业或者其他单位中除国家工作人员以外的其他工作人员。（2）犯罪客体不同。前者侵犯的是复杂客体，后者则仅侵犯了公司、企业或者其他单位的财产所有权。
