认定本罪，应注意以下两个问题：
1.本罪与非罪行为的界限
根据刑法规定，本罪只处罚组织者，对于一般参与卖淫者则不以犯罪论处，而通常按照违反治安管理处罚条例来处理。如果数个卖淫者为了赚取更多钱财，结伙卖淫，相互传递信息、互相提供方便，互为掩护，共同从事卖淫活动的，由于她们都是卖淫者，没有主从之分，也没有较为固定的组织策划者，因此对其一般不应以犯罪论处，而应处以治安管理处罚。但是，如果行为人既自己参与卖淫，又组织他人卖淫的，则构成组织卖淫罪。
2.一罪与数罪的界限
本罪的行为人在组织他人卖淫的过程中通常采用招募、雇佣、强迫、引诱、容留等手段，因此在触犯组织卖淫罪的同时，又可能触犯强迫卖淫罪和引诱、容留、介绍卖淫罪。根据最高人民法院、最高人民检察院的《关于执行〈全国人民代表大会常务委员会关于严禁卖淫嫖娼的决定〉的若干问题的解答》第2条规定： “在组织他人卖淫的犯罪活动中，对被组织卖淫的人有强迫、引诱、容留、介绍他人卖淫行为的，应当作为组织他人卖淫罪的量刑情节予以考虑，不实行数罪并罚。如果这些行为是对被组织者以外的其他人实施的，仍应当分别定罪，实行数罪并罚。”在组织他人卖淫过程中故意重伤害被组织人，则单独构成了故意伤害罪，应当按本罪与故意伤害罪实行数罪并罚。
