二者有相同之处，即都是合同的一方当事人没有履行或者没有完全履行合同，使对方受到损失，并且后者的一方在签定合同时也可能有某种欺骗性的因素，但是，前者是刑事犯罪，后者则是民事纠纷，二者有本质不同。
然而，在实践中，区分二者的界限往往是比较复杂的，二者的根本区别在于行为人有无履行合同的诚意，亦即是否具有非法占有对方财物的目的。没有这一目的，只是因为在履行合同过程中，因遭天灾人祸或市场变化等客观原因，使当事人无能力继续履行合同的，只能作为经济合同纠纷。
1、个人合同诈骗：
（1）数额不满5000元的，单处罚金刑；5000元以上不满1万元的，为拘役刑；1万元的，为有期徒刑六个月；每增加1200元，刑期增加一个月。
（2）个人合同诈骗，数额20万元的，法定基准刑为有期徒刑十年；每增加1.6万元，刑期增加一个月。
2、单位合同诈骗：
（1）单位合同诈骗，数额5万元以上不满8万元的，对直接负责的主管人员和其他直接责任人员处罚金刑；8万元以上不满10万元的，对直接负责的主管人员和其他直接责任人员处拘役刑；10万元，为有期徒刑六个月；每增加3300元，刑期增加一个月；
（2）单位合同诈骗，数额20万元的，直接负责的主管人员和其他直接责任人员法定基准刑参照点为有期徒刑三年；每增加2000元，刑期增加一个月；
（3）单位合同诈骗，数额200万元的， 直接负责的主管人员和其他直接责任人员法定基准刑参照点为有期徒刑十年；每增加1万元，刑期增加一个月。
我国法律对刑事案件管辖权的基本原则是属地原则。《刑事诉讼法》第24条规定：“犯罪案件由犯罪地的人民法院管辖。如果由被告人居住地的人民法院审判更为合适的，可以由被告人居住地的人民法院管辖。”
所谓犯罪地是指实施构成犯罪的一切必要行为的地点，包括犯罪预备地、实施地、结果地和销赃地。对于合同诈骗罪，《最高人民法院关于执行<中华人民共和国刑事诉讼法>若干问题的解释》第2条又进一步明确规定：“以非法占有为目的的财产犯罪，犯罪地包括犯罪行为发生地和犯罪分子实际取得财产的犯罪结果发生地。”
刑事案件一般由犯罪地人民法院管辖，其目的是有利于司法机关收集和核实证据，及时处理案件；便于诉讼参与人参加诉讼和当地群众参加旁听；有利于人民法院了解和掌握本地区刑事犯罪的规律，以采取必要的防范措施。“更为适宜”则是指为了便于查清案情、方便群众，有利于判决后的执行；或者被告人在原居住地罪恶多端、民愤极大，在原居住地审判可以发挥更好教育作用。
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