1、定义不同：
①自诉指被害人、或其法定代理人、近亲属为追究被告人的刑事责任，直接向司法机关提起诉讼，并由司法机关直接受理的刑事案件。
②公诉是指人民检察院对犯罪嫌疑人的犯罪行为向人民法院提出控告，要求法院通过审判确定犯罪事实、惩罚犯罪人的诉讼活动。
2、提起诉讼主体不同：
①自诉是当事人自己提起的诉讼，公诉是检察院依职权主动提起的诉讼。
②公诉是由检察院代表国家向法院起诉，要求追究加害人的刑事责任。
3、提起诉讼条件不同：
①自诉条件：有适格的自诉人；有明确的被告人和具体的诉讼请求；属于自诉案件范围；被害人有证据证明；属于受诉人民法院管辖。
②公诉条件：犯罪嫌疑人的犯罪事实已经查清；证据确实、充分；依法应当追究刑事责任。
在我们国家各级法院审理案件以起诉作为审判前提。如果没人向法院“告状”，法院则不予审理。法院审理刑事案件，分公诉和自诉两种。公诉案件，由人民检察院代表国家向人民法院提起诉讼；自诉案件，由被害人自己或其法定代理人向人民法院提起诉讼。
自诉案件，包括告诉才处理的案件和不需要侦查的轻微刑事案件。所谓告诉才处理，是指某些刑事案件，必须先由被害人或其法定代理人提出控告，否则，法院则不予受理。
不告不理”是人民法院处理自诉案件的一条基本原则。根据新的刑事诉讼法的规定，自诉案件包括下列案件：
1、告诉才处理的案件;
2、被害人有证据证明的轻微刑事案件;
3、被害人有证据证明对被告人侵犯自己人身，财产权利的行为应当依法追究刑事责任，而公安机关或者人民检察院不予追究被告人刑事责任的案件.
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