借钱的时候他把房产证抵押在我这里了，让法院申请拍卖他房子还钱可以不，要是负刑事责任了我的钱怎么办？
根据你的叙述，解答如下，供你参考：
1、首先明确你与朋友之间的借款行为发球民间借贷纠纷，法律给予保护，即你对你朋友享有合法的债权，你朋友应当履行还款的义务；
2、房产抵押行为属于不动产抵押，抵押权自抵押登记时成立。因此，你朋友仅将房地产证留在你处，未办理抵押登记，即使你签订了抵押合同，办理了公证，只要未去国土局或房管局办理抵押登记，你对你朋友名下的房产仍不享有抵押权；
3、你遇到的情况，应当按以下程序维护自己的权益：
（1）保管好相关的借条等材料，作为到时起诉的证据使用；
（2）去法院起诉他，要求还款，并可要求他承诺还款时未还之后的利息；
（3）若要保护你的权益，可以起诉前申请诉前财产保全，对其房产、车辆、银行存款、股权股票等进行查封、冻结，当然，你启动该程序后，必须在十五日内提起诉讼，否则你得赔偿，该程序亦可以起诉时一并启动；
（4）在法院判决你胜诉后，你可以申请法院强制执行；
（5）若房地产证上并非他的名字，而是他父母或哥哥的名字，你不能要求法院拍卖他的房产，因为该房产不是他的财产，他无权处分；
（6）你这是民事纠纷，还算不上刑事。你必须在诉讼时效（自他应当还款之日起两年，若你无证据证明你中途曾催收过该笔欠款）起诉，这样的话，即使他目前名下无财产可供执行，但这债务他一生都背负着，只要你什么时候发现他有财产，你就可以申请法院执行。
