机动车在禁行时间段闯禁区扣3分，罚款100元。
根据法律规定，下列情况扣3分：违反交通信号灯通行、机动车行驶超过规定时速未达50% 、高速公路上驾驶机动车低于规定最低时速、禁止驶入高速公路机动车进入高速公路、违反禁令标志和禁止标线指示、不按规定超车和让行、逆行。
《道路交通安全法》 第九十条
机动车驾驶人违反道路交通安全法律、法规关于道路通行规定的，处警告或者二十元以上二百元以下罚款。本法另有规定的，依照规定处罚。
