后悔不己，而且据说当时退给我的有关部门不合法，能不能补交这部分，或者可否起诉有关部门

要确定能不能补交以及是否可以起诉有关部门，需要结合具体事情的详细情况来判断，以下为你分别分析：

能否补交
了解事情性质 ：需要明确当时退还的是什么款项。例如，如果是社保退费、税款退还等不同情况，对应的补交规则和政策差异很大。
查阅政策依据 ：很多情况下，各类费用的缴纳和退还都有相应的法律法规和政策文件进行规范。你可以向相关的行政主管部门咨询，比如社保费用就咨询当地社保经办机构，税款问题咨询税务部门等，了解对于这种情况是否有补交的可能性和具体的操作流程。
特殊情况考量 ：在某些情形下，如果涉及到行政行为的错误导致退费，经相关部门核实后可能会允许补交；但如果是因为自身不符合缴纳条件而退费，可能就无法补交。

是否可以起诉有关部门
确定行政行为合法性 ：要判断当时退款的部门不合法是否有切实的依据。需要收集能证明退款部门不具备相应权限或退款程序违反法律法规的证据，比如相关的文件规定、部门职责划分等。
判断是否符合起诉条件 ：根据《行政诉讼法》的规定，提起行政诉讼需要有明确的被告、具体的诉讼请求和事实根据，并且属于人民法院受案范围和受诉人民法院管辖。比如，若你认为退款行为侵犯了你的合法权益，就可以考虑起诉。但如果退款行为并未对你的合法权益造成实际损害，可能法院不会受理。
注意起诉期限 ：行政诉讼有严格的起诉期限规定。一般来说，直接向人民法院提起诉讼的，应当自知道或者应当知道作出行政行为之日起六个月内提出。如果超过这个期限起诉，法院可能会驳回起诉。

由于不清楚你所说的“退给我的有关部门不合法”具体所指的事情，建议你详细说明事情的来龙去脉，比如涉及的款项性质、退款部门名称等信息，以便能更精准地为你分析。

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