1、本质不同
（1）
自然人是最基本的民事主体，世界各个国家或者地区民法都有关于自然人的规定。
（2）一般纳税人是指年应征增值税销售额（以下简称年应税销售额，包括一个公历年度内的全部应税销售额）超过财政部规定的小规模纳税人标准的企业和企业性单位。
2、认定标准不同
（1）自然人
民法上的自然人首先是具有自然生物属性的人，自出生起就具有民事主体资格。借助辅助生殖技术的人（如试管婴儿）也是自然人。
（2）一般纳税人
增值税纳税人年度应纳税额超过财政部、国家税务总局规定的小规模纳税人标准的，应当向主管税务机关申请取得一般纳税人资格。年度应纳税销售额不超过财政部、国家税务总局和新开纳税人规定的小规模纳税人标准的，可以向主管税务机关申请取得小规模纳税人资格。法律依据：《
中华人民共和国税收征收管理法》
第一条 为了加强税收
征收管理，规范税收征收和缴纳行为，保障国家税收收入，保护纳税人的合法权益，促进经济和社会发展，制定本法。
第二条 凡依法由税务机关征收的各种税收的征收管理，均适用本法。
第三条 税收的开征、停征以及减税、免税、退税、补税，依照法律的规定执行;法律授权国务院规定的，依照国务院制定的行政法规的规定执行。
任何机关、单位和个人不得违反法律、行政法规的规定，擅自作出税收开征、停征以及减税、免税、退税、补税和其他同税收法律、行政法规相抵触的决定。
第四条 法律、行政法规规定负有纳税义务的单位和个人为纳税人。
法律、行政法规规定负有代扣代缴、代收代缴税款义务的单位和个人为扣缴义务人。纳税人、扣缴义务人必须依照法律、行政法规的规定缴纳税款、代扣代缴、代收代缴税款。
