股权转让合同都撤销了，可以起诉要求撤销股权转让合同把股权变更回来吗？还是行政诉讼？
更新时间：2019-06-30 17:06:08
问题描述：
我们公司于2017年注册，注册资本1000万元，共有三个股东甲乙丙(三个股东私底下有股权协议，分别占股45%、35%、20%)。当时注册时考虑到三个股东不方便露面，用的是朋友姚某做公司法定代表人，并且全部股份登记在姚某名下。
2018年12月，我司进行了工商变更，把姚某的股份分别转让45%给股东甲、35%给股东乙、20%给股东丙，并由股东甲担任新的法定代表人。
因为之前姚某并未出资，所以这次变更股权也没有资金的转让，但由于没有请外面的专业公司去做变更，公司内部做变更的财务也不懂，给到工商的股权转让合同中的转让价格是照抄注册资本的，即合同中写的是“同意姚某将占公司注册资本45%的股权，共450万元以450万元转让给股东甲”、“同意姚某将占公司注册资本35%的股权，共350万元以350万元转让给股东乙”、“同意姚某将占公司注册资本20%的股权，共200万元以200万元转让给股东丙”。现在税务局做变更时，税务局的征收管理员说要姚某缴纳20%即200万的个人所得税。税务局那边的理由是前股东姚某的注册资金1000万元是认缴的，实际没有出钱，转让股权得了1000万，所以要交20%的所得税200万元。我们跟税务局解释说因为公司做变更的文员不懂，导致资料做错，税务局叫我司去工商做更正，但工商那边说股权转让合同已经入了系统，不能更改或撤回了。
我们曾找到工商说想以当事人均协商一致为由，撤销股权转让合同，股权转让合同都撤销了，工商变更的资料不完整，理应要撤销工商变更登记。但工商说这样做工商变更也不能撤销，除非收到法院的撤销通知书才能撤销此次工商变更。
现在有没有好的处理方法？从工商、税务、还是法院那边入手比较好？可以起诉要求撤销股权转让合同把股权变更回来吗？还是行政诉讼？
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