特殊工时制是相对标准工时制而言的，《国务院关于职工工作时间的规定》第五条规定“因工作性质或者生产特点的限制，不能实行每日工作8小时、每周工作 40小时标准工时制度的，按照国家有关规定，可以实行其他工作和休息办法。”这里的 “其他工作时间和休息方法”指的就是特殊工时制。作为一项制度，特殊工时制包括许多种具体的工时制度，我国已实行的主要有：缩短工时制、综合计算工时制、不定时工时制、计件工时制。
申请特殊工时工作制的程序规定：
(一)企业制订特殊工时工作制实施方案，向职工公示5日以上，并通过职工代表大会或开展集体协商等多种形式，充分听取工会组织和职工的意见;
(二)携带以下手续向劳动保障行政部门提出申请：
1、实行特殊工时工作制请示;
2、实行特殊工时工作制申报表;
3、营业执照副本及复印件;
4、实行特殊工时工作制实施方案;
5、职工代表大会(职工大会)或者工会组织对实行特殊工时工作制实施方案的书面意见以及公示情况的报告。
6、实施周期期满企业再次申请的，需书面报告原实施方案的执行情况;
7、职工名册;
8、劳动保障行政部门需要的其他材料。
(三)劳动保障行政部门审批
劳动保障行政部门对企业提供材料进行审核，根据工作需要对企业实地核查，了解企业基本运行情况，对符合特殊工时工作制的企业出具书面审查意见。
(四)经劳动保障行政部门批准后，企业及时将批复在企业显著位置公示5日以上，并按照实施方案和法律法规的各项要求，进行安排落实。
(五)企业安排职工从事特殊工时工作制的工种(岗位)时，应告知劳动者相关事宜，并在劳动合同中明确或在已签订的劳动合同中变更。
附：申请特殊工时工作制的条件规定如下：
(一)依法建立健全劳动合同制度、集体合同制度和考勤制度，劳动用工规范，劳动用工备案和职工名册制度建立，劳动考勤记录完整，劳动定额科学合理;
(二)依法建立健全工资分配与支付制度，执行国家和《江苏省工资支付条例》有关规定，能够依法支付劳动报酬;
(三)依法建立健全劳动安全卫生制度，劳动安全卫生设施和条件符合国家规定标准，执行国家有关女职工和未成年工特殊保护的规定;
(四)维护职工人格尊严和安全健康、休息休假的权利，禁止以暴力、威胁或者非法限制人身自由的手段强迫实行综合计算工时工作制、不定时工作制;
(五)实际用工企业使用劳动力派遣单位人员，所在岗位。
确需实行综合计算工时工作制或不定时工作制的，应由实际用工企业向劳动保障行政部门申请，但申请前应征得劳动力派遣单位的同意。
