一、医疗纠纷刑事诉讼比例低
以医疗事故罪启动诉讼的案件不多，可以称之为低侦查、低起诉、低定罪、低执行的“四低”状态。与我国每年的医疗量、医疗纠纷量相比，涉及医疗纠纷的刑事诉讼的比例是非常低的。即便是被确定构成医疗事故罪的案件，判处的刑罚都比较轻微，且往往以缓刑执行。
总的来看，我国被起诉和最终定罪的医疗事故犯罪案件基本相当，这与我国台湾地区医疗事故犯罪案件呈现的高侦查、低起诉、低定罪、低执行的现象不同。台湾地区出现这种“一高三低”特点的原因在于其司法体制让公民很容易启动刑事诉讼，所以出现了“以刑逼民”的现象。但是不能排除有人利用刑事诉讼的压力来逼迫医疗机构和医务人员给予患方更多赔偿的情况。实际上，2014年底北京、福建的两个案件，患方就获得了超出一般水平的高额赔偿。
二、基层机构和人员涉案风险高
在24例医疗事故犯罪案件中，从专业上来看，主要是护理和妇产科；从医疗行为看，主要是输液和接生；从结果上看，主要是患者死亡，造成严重残废被追究医疗事故罪的仅1例；从涉及的医疗机构来看，主要是基层医疗机构，以村卫生室、卫生所和个体诊所为主；从医务人员的技术级别来看，主要是乡村医生和执业助理医师；从发生的地域来看，基本上在农村，偶有县城医疗机构，很少涉及大中城市的医疗机构；从分布的省份来看，主要集中在中部地区，其中河南省有8例之多。这些特征为防范医疗事故犯罪提供了明确的方向。
三、技术鉴定未得到足够重视
在一审案件中，虽然大多数案件都做了医疗事故技术鉴定，但仍然有近1/3的案件未做，其中，有的案件是由法医做了司法鉴定，有的案件则是没有做任何鉴定。
在认定犯罪构成中有一个非常重要的问题，即不负责任的行为与患者的损害后果之间是否存在因果关系。除非因果关系一目了然，否则需要通过技术判断才能确定的。而有些地方法院把法医做的司法鉴定结果作为定罪的依据，这违反了《医疗事故处理条例》有关医疗事故技术鉴定的规定。
四、二审中改判案件数量不少
医疗事故犯罪以医疗事故罪为主，间或出现过失致人死亡罪，而且在司法实践中，有时对医疗事故罪、非法行医罪难以区别，所以在二审案件中出现了40%的改判率，且都改判为较轻的刑罚甚至无罪。
需要明确的是，医疗事故罪本身就是过失致人死亡、重伤罪的一种，只是由于犯罪主体与行为特殊，所以才从过失致人死亡、重伤罪中分离出来。对于医务人员在医疗活动中因过失致患者死亡、残废的，只能定医疗事故罪，不能定过失致人死亡罪或者过失致人重伤罪。
另外，由于在司法实践中出现了医疗事故罪与非法行医罪的混淆问题，最高人民法院在2008年4月29日公布的《关于审理非法行医刑事案件具体应用法律若干问题的解释》 中对非法行医罪犯罪构成中的关键要素进行了明确的规定。
