在很多情况下，医疗纠纷发生后，医患双方基于不同的考虑，通常会通过申请行政部门调解达成协议，如果一方当事人在履行和解协议时反悔而提起诉讼时，司法实践中，不同的法院对该协议的效力的认定也不同。
依法成立的合同，对当事人具有法律约束力。当事人应当按照约定履行自己的义务，不得擅自变更或者解除合同。依法成立的合同，都法律保护。通常认为，正常状态下的医患关系应视为医疗服务合同关系，属于合同法调整的对象。医疗纠纷发生后，双方本着自愿，平等的原则，在充分协商的基础上达成和解协议，或者通过行政部门调解达成协议，应认定该协议的效力。因此，只要是双方自愿的情况下，医疗纠纷调解后反悔是不可以的。
医患双方的和解，发生医疗事故的赔偿等民事责任争议，医患双方可以协商解决。
协商解决医疗纠纷是司法自治原则的具体体现。民事主体可以在符合法律规定的范围内自由处分自己的民事权利，因此医患双方当事人可以在法律允许的范围内对医疗事故的赔偿等责任的争议通过自行协商的方式加以解决。
医患双方协商的成果--协议书，具有民事合同的性质。因此，协议一经达成，双方当事人应当自觉履行。但是，由于其是一种私下协议，因此，对人民法院审理案件不具有约束力，任何一方当事人在协议达成后，仍然可以“协议存在重大误解”、“显失公平”等提起诉讼，不能因此产生剥夺或者限制一方当事人诉权的法律效力。
但是和解协议书毕竟属于双方的和约，因此，对于已经达成协议的案件的审理，原则上人民法院应当按照合同纠纷来审理。不再按医疗赔偿合同纠纷案件审理。但调解协议无效或者需要撤销的除外。
医疗协议书在双方签字前可以撤销，但双方一经签字，该协议书即生效，双方不可再更改只能按照协议书履行。依据《医疗事故处理条例》第四十七条规定，双方当事人协商解决医疗事故的赔偿等民事责任争议的，应当制作协议书。协议书应当载明双方当事人的基本情况和医疗事故的原因、双方当事人共同认定的医疗事故等级以及协商确定的赔偿数额等，并由双方当事人在协议书上签名。
第四十八条规定，已确定为医疗事故的，卫生行政部门应医疗事故争议双方当事人请求，可以进行医疗事故赔偿调解。调解时，应当遵循当事人双方自愿原则，并应当依据本条例的规定计算赔偿数额。经调解，双方当事人就赔偿数额达成协议的，制作调解书，双方当事人应当履行；调解不成或者经调解达成协议后一方反悔的，卫生行政部门不再调解。
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