卫生行政部门接到医疗机构关于重大医疗过失行为的报告或者医疗事故争议当事人要求处理医疗事故争议的申请后，对需要进行医疗事故技术鉴定的，应当交由负责医疗事故技术鉴定工作的医学会组织鉴定。
医患双方协商解决医疗事故争议，需要进行医疗事故技术鉴定的，由双方当事人共同委托负责医疗事故技术鉴定工作的医学会组织鉴定。
当事人已向人民法院提起民事诉讼的（司法机关委托的除外）。由当事人向人民法院申请医疗事故技术鉴定，人民法院受理后委托医学会进行医疗事故技术鉴定。
医疗纠纷投诉可以按照以下流程进行处理：
1、卫生行政部门可以在接到医患双方对于医疗纠纷的投诉后，在双方当事人均同意的情况下组织双方当事人进行协商；
2、当双方当事人不能协商一致或者一方当事人不同意协商的，可以让他们到医疗纠纷发生所在地的基层人民法院进行民事诉讼；
3、发生医疗事故的赔偿等民事责任争议，医患双方可以协商解决；不愿意协商或者协商不成的，当事人可以向卫生行政部门提出调解申请，也可以直接向人民法院提起民事诉讼。
发生医疗事故的赔偿等民事责任争议，医患双方可以协商解决即和解，不愿意协商或者协商不成的，当事人可以向卫生行政部门提出调解申请，也可以直接向人民法院提起民事诉讼。由此可见，在我国，发生医疗纠纷有三种解决方式，即和解、调解和诉讼。
1、和解（协商解决）；
发生医疗纠纷后，患方和院方可本着平等自愿的原则，在充分协商的基础上达成和解协议，和解协议的效力应予以认定。
2、调解（卫生行政部门等第三方介入）；
已确定为医疗事故的，卫生行政部门应医疗事故争议双方当事人请求，可以进行医疗事故赔偿调解。
3、诉讼；
在诉讼之前，当事人可以进行医疗事故鉴定或者医疗过错鉴定，医疗事故鉴定由医学会鉴定，医疗过错鉴定由司法鉴定中心鉴定。进行鉴定并不是医疗纠纷诉讼的法定前置程序。
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