非法行医的医疗事故可以参照医疗事故处理条例的相关规定来进行处理。
处理医疗事故的一般程序主要适用《医疗事故处理条例》规定的程序。同时，处理医疗事故的一般程序还适用《中华人民共和国民事诉讼法》、《中华人民共和国行政诉讼法》和《中华人民共和国刑事诉讼法》等法律的规定。医疗事故处理的一般程序：
１、报告
《医疗事故处理条例》第十三条规定：“医务人员在医疗活动中发生或者发现医疗事故，可能引起医疗事故的医疗过失行为或者发生医疗事故争议的，应当立即向所在科室负责人报告，科室负责人应当及时向本医疗机构负责医疗服务质量监控的部门或者专（兼）职人员报告；负责医疗服务质量监控的部门或者专（兼）职人员接到报告后，应当立即进行调查、核实，将有关情况如实向本医疗机构的负责人报告，并向患者通报、解释。”
２、及时采取措施防止损害扩大
《医疗事故处理条例》第一十五条规定：“发生或者发现医疗过失行为，医疗机构及其医务人员应当立即采取有效措施，避免或者减轻对患者身体健康的损害，防止损害扩大。”医疗机构采取的及时有效的措施包括：为确认过失行为造成的损害程度而进行必要的辅助检查；为减轻损害后果而采取必要的药物、手术等治疗方法；为避免医疗事故争议而采取的其他措施。这些措施应具有很强的针对性和有效性，以力争把对患者造成的损害程度降低到最低。
３、保管各种资料，封存现场实物
掌握第一手资料和证据，是对医疗事故或事件做出准确鉴定、准确定性、正确处理的前提条件。因此，医疗单位在接到有关当事医务人员、其所在科室发生医疗事故的报告以后，应依法做好保管和封存工作，以免发生不利于医疗事故处理的事情。
４、调查
医疗单位对发生的医疗事故或事件，应立即进行调查、处理，并报告上级卫生行政部门。个体开业的医务人员发生的医疗事故或事件，由当地卫生行政部门组织调查、处理。病员及其家属也可以向医疗单位提出查处要求。对医疗事故或事件进行调查的过程，实际上就是为处理医疗事故或事件寻找根据，分析造成事故或事件的原因和过程，这是整个处理医疗事故或事件的关键环节。
５、做出结论
医疗事故处理部门应在调查、研究的基础上，最后做出对事故的处理意见。对不构成医疗事故的案件，应以书面形式详细地向患者及其家属说明情况和理由。对构成医疗事故的案件，则要根据《医疗事故处理条例》及其他法律法规的规定，责令医疗责任人员承担民事责任或行政责任，对构成医疗事故罪的，要依法追究其刑事责任。
医疗纠纷情况复杂，政策性强，医疗单位和卫生行政部门在接待和处理上必须严肃认真，做好各个环节的工作。
根据《医疗机构管理条例》，非法行医主要应包括下列６个方面：
１、未取得《医疗机构执业许可证》擅自执业的。
２、逾期不校验《医疗机构执业许可证》仍从事诊疗活动的，或者拒不校验的。
３、出卖、转让、出借《医疗机构执业许可证》的。
４、诊疗活动超出登记范围的。
５、使用非卫生技术人员从事医疗卫生技术工作的。
６、出具虚假证明文件的。
根据《执业医师法》，非法行医应包括下列２个方面：
１、未经批准擅自开办医疗机构行医。
２、或者非医师行医的。
根据《母婴保健法》未取得国家颁发的有关合格证书的，有下列行为之一：
１、从事婚前医学检查、遗传病诊断、产前诊断或者医学技术鉴定的；
２、施行终止妊娠手术的；
３、出具《母婴保健法》规定的有关医学证明的。或者出具有关虚假医学证明或者进行胎儿性别鉴定的。
《医疗事故处理条例》第四十六条规定，发生医疗事故的赔偿等民事责任争议，医患双方可以协商解决；不愿意协商或者协商不成的，当事人可以向卫生行政部门提出调解申请，也可以直接向人民法院提起民事诉讼。
第四十七条规定，双方当事人协商解决医疗事故的赔偿等民事责任争议的，应当制作协议书。协议书应当载明双方当事人的基本情况和医疗事故的原因、双方当事人共同认定的医疗事故等级以及协商确定的赔偿数额等，并由双方当事人在协议书上签名。
以上就是找法网小编为您整理的关于非法行医的医疗事故如何处理的全部内容了。综上可知，非法行医的医疗事故可以参照医疗事故处理条例的相关规定来进行处理，同时非法行医的行为人要承担相关的责任。如果您还有其他的法律问题，欢迎咨询我们的找法网律师。
