1、劳动合同履行不规范，权利义务关系不明确。用人单位和劳动者签定的劳动合同中，用人单位对劳动者工资报酬、合同期限、“三金”缴纳等有关规定含糊其辞，有的故意回避应承担的义务，在终止、解除劳动合同时，不按规定支付经济补偿金，有的用人单位直接不签订或拖延签订劳动合同，有的则采取签订 “霸王合同”、“生死合同”等方式，侵犯劳动者的合法权益。
2、安全生产意识淡薄。在起诉到法院的劳动争议案件中，为落实工伤事故待遇引起的纠纷占一定比例，其中建筑工人受伤主张权利的居多，主要原因在于具有建设施工资质的承包人将工作(或部分)转包(或分包)给个人组织人员承建，由于分包人没有建设资质、安全生产管理不善、措施不到位等原因，容易导致工伤事故发生。再加上分包人作为用工者未依法给工人缴纳保险，分包人无力解决受害者的工伤待遇，而发包人和承包人、分包人互相推诿，导致受害者的伤亡待遇得不到解决，从而引发纷争。
3、企业改制、事业单位改革中，未能妥善处理历史遗留问题。近几年来，随着改革的不断深入，国有、集体企业改组、改制、改造的力度不断加大，部分事业单位为精减机构提高工作效率，也裁减了富余人员，如允许企事业单位职工停薪留职、“下海”经商，有的则作下岗、待岗、轮岗处理，由此引起劳动合同变更、解除，由于未按法律和政策规定来处理劳动关系，从而引发劳动争议甚至是群体性劳动争议。
4、部分民营企业存在大量事实劳动关系。部分民营企业、个体私营企业和个体经济组织使用劳动者的现象非常普遍，但在具体用工过程中，劳动者尤其是季节性、临时性的外地打工者，并未与用工单位签订书面的劳动合同，对劳动工资、工作期限、福利报酬和劳动保障条件等，一般都是口头承诺，未进行明确的书面约定，在实际劳动中就劳动关系是否成立易产生各种争议和纠纷。
