政府财政性资金收支审计中，银行存款方面出现舞弊行为的一般目的是为了掩盖有关人员挪用或贪污等问题。由于财政性资金收支相对于企业来说，业务环节和会计核算比较简单，在这种情况下，意图造假的管理人员通常不遵守或不设置内控制度，采用伪造签名、印章印鉴或银行对账单等手段实施舞弊。针对这些情况，审计人员应注意以下几个方面。
(一)审查内控制度的设立和应用情况，确定货币资金审计的方向和重点。要采用观察、询问等方法，重点了解银行存款的收支是否按规定的程序和权限办理。出纳与会计的职责是否严格分离;银行存款日记账是否根据经审核后合法的收付款凭证登记入账;是否根据不同的银行账号分别记录，是否逐笔序时登记;支出是否经过核准、审批;支票是否按顺序签发，作废支票是否加盖“作废”戳记，并与存根一同保存;是否定期取得银行对账单并编制银行存款余额调节表等。要采用审计抽样技术，抽取一定的样本，对内部控制制度进行符合性测试，并根据测试结果，评价内部控制，估计控制风险，确定实质性测试的关键点和程序。如果被审计单位没有编制银行余额调节表，要由非出纳人员逐笔核对银行日记账和银行对账单，并编制银行余额调节表。审计人员可抽取大额项目进行检查并核对余额。
(二)检验领导签名、印章的真伪。需要审计人员具备一定的印章或签名的鉴定经验。
(三)银行对账单信息的鉴别与核对。首先，要鉴别银行对账单的真伪。要对各商业银行的对账单格式有所了解，将有疑点的对账单与同一银行的已确认为真实的对账单进行核对，比较印章、纸质和格式，看是否为真。在有疑问且有条件的情况下，带着对账单到银行进行鉴定或要求银行重新提供对账单。此外，还有一些小技巧也可以鉴定对账单的真伪，比如，单位活期存款一般按季结息，每季末月20日为结息日。用计息基数乘以相应的日利率，就得出本季度账户应付利息。计息的公式为：利息=本季计息基数×日利率。选取被审计单位部分对账单进行抽查，看结息日是否正确以及利息计算是否准确。用此方法，笔者曾经在某县财政局查出该局伪造银行对账单以及相关账簿，意图掩盖挪用国债资金的问题。
(四)根据确定的实质性测试的关键点和程序，对银行存款账户进行审计。核对被审计单位会计报表、总账、明细账中的银行存款余额，确认其是否相符。若不相符，应查明原因，评价其差错对报表的影响，弄清是否存在故意行为。
