国税发[2005]9号文件基本规定是：“纳税人取得全年一次性奖金，应单独作为一个月工资、薪金所得计算纳税”。
1、发放年终奖的当月工资高于3500元时，年终奖扣税方式为：年终奖*税率-速算扣除数，税率是按年终奖/12作为“应纳税所得额”对应的税率。
2、当月工资低于3500元时，年终奖个人所得税=(年终奖-(3500-月工资))*税率-速算扣除数，税率是按年终奖-(3500-月工资)除以12作为“应纳税所得额”对应的税率。
(一)员工当月的工资薪金超过「3500」元，再发放的年终奖单独作为一个月的工资计算缴纳个人所得税。
全年一次性奖金，单独作为一个月计算时，除以12找税率，但计算税额时，速算扣除数只允许扣除一次。
(二)员工当月的工资薪金不超过3500元，再发放的年终奖单独作为一个月的工资计算缴纳个人所得税。
但可以将全年一次性奖金减除“雇员当月工资薪金所得与费用扣除额的差额”后的余额，作为应纳税所得额。其中“雇员当月工资薪金所得”以收入额扣除规定标准的免税所得(如按规定缴纳的社会保险和住房公积金等)后的数额。
(三)员工一个年度在两个以上单位工作过，只能按照国税发[2005]9号文件规定，在一个纳税年度内，对每一个纳税人年终奖计税办法只允许采用一次，纳税人可以自由选择采用该计税办法的时间和发放单位计算。
网上申报当月工资薪金和年终奖的个税，同一个人应同时录入两条申报记录，所得项目为“正常工资薪金”和“全年一次性奖金收入”，分别填列对应的“收入额”等项目进行申报。进行年终奖申报个税时需要注意以下几点：
(一)进行“年度奖金”申报时，必须填写“当月发放工资金额”，该数字是作为判断年度奖金计算的依据。如果实际当月有发放工资但在进行“年度奖金”申报的时候不填写或填写“正常月薪收入”为0的，则会导致年度奖金税额计算错误造成少缴税款。
(二)“年度奖金”申报仅计算年度奖金收入的税额，不包括正常月薪收入税额计算。如果当月申报的收入包括正常月薪收入和年度奖金的，则正常月薪收入应另行按“正常月薪收入”进行申报。
(三)“年度奖金”申报中所填写的人员“当月发放工资金额”应和“正常月薪收入”申报中填写的金额一致。
基本规定是：“纳税人取得全年一次性奖金，应单独作为一个月工资、薪金所得计算纳税”。
年终奖个人所得税计算方式：
1、发放年终奖的当月工资高于3500元时，年终奖扣税方式为：年终奖*税率-速算扣除数，税率是按年终奖/12作为“应纳税所得额”对应的税率。
2、当月工资低于3500元时，年终奖个人所得税=(年终奖-(3500-月工资))*税率-速算扣除数，税率是按年终奖-(3500-月工资)除以12作为“应纳税所得额”对应的税率。
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