电子商务公司主导的电子信用证业务影响较大的是由3大电子商务公司推出的系统。
美国纽约市的电子商务公司的Tradecard系统 其运作流程包括交易撮合、货物运输、货款支付几个阶段。Tradecard除提供电子市场撮合契约外，其付款审核单据机制整合Coface付款保证机制与 Thomas Cook汇兑转帐机制，建置创新的财务供应链管理，整合谈判、订约、付款及运送的信息管理作业，大幅降低贸易文件使用成本。同时，Tradecard系统将贸易中使用电子文件作为买卖双方履约运送及付款的查核参考，避免了实体交易上贸易文件的使用及其电子化所面临的可能困扰。
以伦敦作为主营业所在地的电子商务公司开发的管理系统BOLERO BOLERO是一个开放、中立、高度安全、合法的，以互联网为支持、以核心信息平台为主构架的电子网络，致力于消除纸上贸易。使用者签署协议成为成员后，通过互联网交换单据、核查数据，完成贸易过程、注册申请后，允许在线转让货物所有权。BOLERO提供的电子信用证支付方式起始于承运人通过核心电讯平台按发货人的要求签发的一份电子提单， BOLERO权利注册系统将一个信用证项下的所有信息(包括电子提单、电子保险单、电子商检证书等)捆绑到一起(以下称为捆绑提单)，并根据指示确定提单的持有人;捆绑提单信息的流转是通过当前捆绑提单持有人向权利注册系统发出指定另一提单持有人的指令来进行，发货人指定银行为提单持有人时，银行应完成信用证项下垫付货款责任;银行再指定买方为提单持有人时，买方应完成付款赎单责任。当最后收货人成为捆绑提单的持有人时，他可以将捆绑提单通过电子手段交回给承运人或承运人指定的其他人，并要求提货。
中国国家金关工程主干网，即中国国际电子商务网在2005年也推出了BOLERO电子信用证通知系统，为我国出口商从金融机构接收信用证通知提供更快速、有效的方式。
加拿大电子商务软件公司开发的CCEWeb系统 该系统将信用证的功能和信用卡相结合，集成了基于因特网的贸易支付、贸易流程和单证管理等多项功能，可进行全球贸易。该系统的核心是“单据清算中心”，其功能类似于银行的融资部，将贸易、运输、保险、融资等各类单据集中处理并进行传递。信用证项下的支付通过单据清算中心进行，运作方式和银行处理信用证交易一样，中心将检查受益人所提交单据的表面一致性，并在支付受益人后结束整个交易过程。CCEWeb系统提供了一个安全的电子交易平台，但是CCEWeb系统没有提供一个权利登记中心来实现买卖双方之间的物权转移。
在我国由电子商务公司主导的电子信用证实践中，典型的是贸易担保网(www.1001yes.net)。该网站由中共中央统战部华兴经济咨询服务中心负责网站的宣传和推广，中国建设银行负责客户的资金管理，北京市沙夫垂网络技术有限公司负责技术维护，其网上信用证下的交易程序如下：买方依据贸易合同在网上填写“信用保证书”，卖方在网上确认信用保证书，买卖双方分别提交10%和5%的履约保证金给担保公司;担保公司收到保证金后通知卖方备货;卖方备货后在网上输入“卖方货已备妥通知”;担保公司通知买方补足货款;担保公司收足货款后通知卖方发货;卖方发货后在网上输入“卖方发货通知”并将议付单据交担保公司;担保公司审核单据后将单据交买方，买方凭单据向承运人领取货物。这是一种类似于“直通信用证”的业务，其业务方式不但改变了信用证的形式，也彻底改变了信用证的内在性质。
