一、企业资金分帐制度相关问题
资金分帐制度即划分国家资金和企业资金，分别列帐。
具体操作：承包前企业占用的全部固定资产和流动资金，列为国家资金，承包期间利用贷款形式的固定资产。用留利还贷的，划入企业资金；税前还贷的，按承包前国家与企业的利润分配比例，折算成国家资金和企业资金。承包期间所提到的固定资产折旧基金，按固定资产中国家资金和企业资金的比例，分别列为国家资金和企业资金。
实行资金分帐制度，必须注意以下两点：
(1)无论是国家资金还是企业资金，都是全民所有制财产；
(2)承包方对企业资金必须合理使用。通常企业资金应当作为承包经营企业的风险基金。承包期满后转入下期承包的企业资金。
承包经营责任制并不改变企业的法律地位。企业承包后，对外签订合同的主体并不是由企业变为企业经营者。因此无论是承包前的债权债务，还是承包后的债权债务，它的承受者都是企业。承包方特别是企业经营者不能借口这些债务是承包以前的，而拒绝接受或承担责任。应在合同中明确约定前，即核定承包基数时，把承包前的债权债务考虑进去，并据此合理地确定利润基数和递增比例。如果确定承包基数和递增比例时没有考虑到承包前的债权债务，那么在承包过程中，企业应以债权人和债务人的身份负责受领或清偿。然后，对受领的债权，按其数额加进上缴利润指标；对清偿债务的支出，应从上缴利润指标中减去。
三、财务控制问题
业务可以承包，但是财务人员必须牢牢控制在股东手中，财务一旦混乱或被承包人控制，这个公司将会出现很多虚假账务，甚至被掏空，所以在签订承包经营合同时，必须对财务人员的选聘权有明确约定。按照公司治理、会计制度规范和强制性法律规定，财务也应当是规范和独立的。此外，承包人经营期间所负债务，对外应当由公司承担，对内可以按照约定由承包人承担，为了避免对外债务的风险，发包人应当控制财务。
三、承包经营期间公司法定代表人、股东重大权益、印章保管问题
承包人承包人可以作为法定代表人，但是必须约定制约机制，否则承包人有经营权、用人权、财务权，权利大到极致就没有监督，必然出现混乱。股东会和董事会必须继续发挥作用，切不可因为承包经营而退出。股东对于重大股权，比如公司改制、增减股、分立、合并、兼并、重大投资、应经方向大的变化等等，这些股东权益不能擅自放弃或承包。公司印章一般会交给承包人保管，但是这样容易后患无穷，为了防止虚假合同、虚构债务等等，最好公司设专人保管印章，反所签章之文件，必须有承包人或承包人制定的人签字并留备份。
四、公司承包经营期间的收益分配不得违反法律规定
承包经营合同违反公司法有关提取法定公积金、公益金规定等规定无效。《公司法》规定“公司分配当年税后利润时，应当提取利润的百分之十列入公司法定公积金。公司法定公积金累计额为公司注册资本的百分之五十以上的，可以不再提取。公司的法定公积金不足以弥补以前年度亏损的，在依照前款规定提取法定公积金之前，应当先用当年利润弥补亏损。股东会、股东大会或者董事会违反前款规定，在公司弥补亏损和提取法定公积金之前向股东分配利润的，股东必须将违反规定分配的利润退还公司”。如承包经营合同违反此规定无效。
综上，企业签订承包合同之前要对企业资金分帐制度/签订承包合同前的债权债务/财务控制/承包经营期间公司法定代表人、股东重大权益、印章保管/公司承包经营期间的收益分配不得违反法律规定五方面严格控制。
