当事人在约定合同变更时的程序如下：
1、一方当事人向另一方当事人提出变更合同的请求。
不管是哪一方当事人提出变更合同的请求，都要就合同变更的理由、内容、条款和条件等做出说明，并给对方当事人一个答复的期限。
2、被请求方按期向请求方做出答复。
被请求方在接到请求方变更合同的要求后，要在请求方给出的期限内给予答复，不准对对方的请求置之不理。被请求方的这种答复也可以是同意，也可以提出自己不同的意见，供双方进一步协商；对于不符合法律规定的请求，被请求方可以表示不同意。
3、双方协商，达成书面协议。
双方当事人就要其变更的合同内容和条款进行协商，在取得一致意见的基础上，达成和拟定书面协议；书面协议要就变更的内容和条款进行详细说明，并就变更后的条款生效日期做出规定。书面协议要经双方当事人签名、盖章后才能生效。
4、备案或签证。
凡在订立是经过备案或鉴证的合同，变更合同的书面协议也需要送交主管部门备案，或到鉴证机构办理鉴证手续。需要鉴证的变更协议，只有在鉴证后才能生效。
除了当事人协商变更合同，合同变更还有以下几种情形：
1、在法律的基础上直接规定变更合同，如债务人违约致使合同不能履行，履行合同的债务变为损害赔偿债务。
2、在合同因重大误解而成立的情况下，有权人可诉请变更或撤销合同，法院裁决变更合同。
3、在情事变更使合同履行显失公平的情况下当事人诉请变更合同，法院依职权裁决变更合同。
4、形成权人行使形成权使合同变更。
以上就是小编为您介绍的关于合同变更的程序以及情形，希望对您有所帮助。
