不同性质的公司办理股权转让的程序不同。
(1)民营企业一般直接到工商行政管理局办理股权转让登记。
(2)外资企业一般先到商务局进行审批，审批完成后才能到工商行政管理局办理股权转让登记。
(3)国有企业需先经国资委或者国资委下属单位审批，审批完成后到工商行政管理局办理股权转让登记。
仅就民营企业为例，股权转让的具体办理流程如下：
1.股东会和董事会需就股权转让事宜形成决议。
2.转让方、受让方签订股权转让协议。
3.转让方和受让方到主管税务机关办理纳税申报。
4.向工商行政管理局申请办理工商变更登记。
此外，股权转让还涉及税务申报，一般情况下，转让方和受让方需先到主管税务机关办理纳税申报;然后持完税凭证再到工商局办理股权变更登记手续。
实务操作过程中，部分省市，纳税申报和股权变更登记手续也可以同时进行。具体建议您先咨询一下当地的工商行政管理部门。
根据《公司法》、《公司登记管理条例》等法律法规的规定，股权转让一般需满足以下要件。
《公司法》第36条规定：“股东依法转让出资后，由公司将受让人的姓名或者名称、住所以及受让的出资额记载于股东名册。”第145条第2款规定：“记名股票的转让，由公司将受让人的姓名或者名称及住所记载于股东名册。”《公司登记管理条例》第5条规定：“有限责任公司变更股东的，应当自股东发生变动之日起30日内申请变更登记，并应当提交新股东的法人资格证明或者自然人的身份证明。”所以，公司变更登记是股权转让的法定要件。
根据我国《合同法》第44条第2款的规定：“法律、行政法规应当办理批准、登记等手续生效的，依照其规定。”只要股权转让的行为未经过变更登记，都应当认定股权转让行为不发生法律效力;同理，根据我国《公司法》第36条的规定，《公司登记管理条例》的规定，股权转让还应当向工商行政管理机关申请变更登记，股东转让出资未经过公司变更登记的行为，也应当认定股权转让行为不发生法律效力。
股权转让是指有限责任公司的股东将其持有的股权出让给他人的法律行为。
股权转让主要涉及到增值税、企业所得税、个人所得税、印花税等税种。
当转让方为个人时，只需按照20%的税率缴纳个人所得税。
当转让方为公司时，涉及到的税费比较多。
第一，转让股权取得的收入属于企业收入，应当依法缴纳企业所得税。税率视公司类型不同而略有区别，一般情况下为25%，符合条件的小型微利企业为20%。国家需要重点扶持的高新技术企业为15%。
第二，因为股权转让书需要贴花，所以公司需要按照转让书所载金额的万分之五缴纳印花税。
第三，营改增后股权转让是否缴纳增值税，由于持股主体和转让对象的复杂性，法律目前还没有统一的规定。在实践中，转让非上市公司股权不属于增值税征税范围。
另外，在增资扩股中，对以土地、房屋权属作价入股或作为出资投入企业的，还需要缴纳契税。
股权转让是法律所允许的行为，因此固然需要遵守法律的规定，按照相应的流程以及达成相应的条件后才能够进行股权转让。以上即是股权转让是怎么办理流程的相关知识。这些便是找法网小编为大家带来的知识，若还其他问题需要咨询，欢迎咨询找法网。
