这主要表现为股东人数瑕疵以及股东资格瑕疵。就股东人数瑕疵而言，既有低于股东最低人数的瑕疵，亦有高于股东最高人数的瑕疵。尽管世界范围内已普遍允许一人公司的设立与存续，即便如此，亦有可能因为一人股东的虚拟而使得该公司的股东低于一人股东人数的法定要求，更不用说，有些国家对其公司股东的最低人数仍然有着更高的要求。
这一方面的瑕疵表现受资本模式的影响较大。在实收资本模式或者折衷资本模式下，由于普遍要求公司设立时的最低资本额以及全部或部分比例的实缴资本到位，有时还要求相应的部门以及人员对出资的真实进行验资，从而使得此类资本模式下因资本瑕疵所引发的瑕疵公司情形较为普遍。而授权资本模式下，由于公司设立很少有最低资本额的法定要求，更不存在应缴资本比例以及验资等法定要求，故公司设立尽管也需要注明资本或股份，但至少公司不会因为股东所缴资本的多寡而难以成立，因而授权资本模式下因资本瑕疵所引发的瑕疵公司情形并不常见。
这是指公司章程缺乏必载事项或所载事项与法律存有冲突之情形。具体又可分为公司目的瑕疵、公司名称瑕疵以及其它必载事项瑕疵。
公司瑕疵设立有效公司瑕疵设立有效理论认为，即使公司设立存在着瑕疵，所设立的公司也是有效的，无论是公司股东还是公司债权人均不能以公司设立瑕疵为由向法院提起诉讼，要求法院宣告公司设立行为无效。英美国家采取这种做法。
如果公司的设立存在瑕疵，公司的设立行为应属无效，公司的股东和其他利害关系人可以提起无效诉讼。大陆法系国家采取这种做法。
公司设立如果存在瑕疵，可由行政主管机关予以撤销。
由于公司设立无效与司法撤销的具体模式与法律后果均基本相同，因此我国不妨仿效日本、韩国公司法将二者分别加以规定，确立公司瑕疵设立无效制度即可。
关于公司瑕疵设立无效的事由，各国和地区公司法的规定不尽相同.具体情形主要是：
其一，公司章程欠缺或违法。如《德国股份法》第275条第1款规定：“章程不包含关于股本数额或关于经营对象的规定，或章程关于经营对象的规定为无效的，任何一名股东以及任何一名董事会和监事会成员，均可以提起宣告公司无效的诉讼。不得因其他理由提起此种诉讼。”
其二，股东无行为能力。如《法国商事公司法》第360条规定：“公司无效或修改公司章程行为的无效，只有根据本法的明文规定或规定合同无效的条款，始可宣布。第365条规定：“公司成立后，因股东的无行为能力，公司无效。”
其三，法院依职权确定的原因。如日本法的规定，公司设立无效是由法院根据股东申请依职权来判定的。法院依职权实际是法官按照基本的法律原则来确定，如果公司设立过程中有违法行为，均可认定为设立无效。我国可将公司设立无效的事由规定为如下几种：公司章程未包含股本数额或经营对象的规定;章程关于经营对象的规定无效;公司的设立或其他登记事项有伪造、变造文书;股东虚假出资等。
为贯彻商法的企业维持原则并维护交易安全，我国应尽可能维持瑕疵设立公司的法律人格，并明确规定设立无效的阻止与迟延制度;首先，应规定除非公司经营对象严重违法或严重损害了社会公共利益，相关当事人在提起设立无效诉讼之前，应给予公司以通过合法程序对设立瑕疵予以补正的一定期限。只有在该期限届满之后仍未能补正瑕疵，才能行使诉权。其次，规定当事人行使公司设立无效诉讼请求权的期间，借鉴国外立法例的规定.该期间可为2年，并应为除斥期间。再次，为了防止请求权人滥用诉权，可规定原告败诉时，如果其有恶意或重大过失，应对公司承担连带赔偿责任。
在国外，关于公司设立无效之诉原告的资格规定不—，如日本和韩国规定只有股东社员才能作为原告提起公司设立无效诉讼，《德国股份法》规定股东、董事、监事均可作为原告起诉。我国公司设立无效之诉的原告不宜限制过多，可为股东、董事、监事、债权人及其他利害关系人。
在法律效果上，公司设立无效判决与行政撤销将导致公司解散，但为了保护交易的安全，其应当不具有溯及力。
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