解决公司设立瑕疵问题的方法为：
1、什么是公司设立瑕疵?
所谓公司设立是指发起人为组建公司并使其取得法人资格，依照法律规定实施的多种连续的准备行为。公司设立瑕疵则是指经公司登记机关核准登记并获营业执照而宣告成立的公司，其设立过程不符合公司法规定的条件和程序的情形。
2、公司设立瑕疵有哪几种情形?
（1）股东瑕疵
这主要表现为股东人数瑕疵以及股东资格瑕疵。就股东人数瑕疵而言，既有低于股东最低人数的瑕疵，亦有高于股东最高人数的瑕疵。尽管世界范围内已普遍允许一人公司的设立与存续，即便如此，亦有可能因为一人股东的虚拟而使得该公司的股东低于一人股东人数的法定要求，更不用说，有些国家对其公司股东的最低人数仍然有着更高的要求。
（2）资本瑕疵
这一方面的瑕疵表现受资本模式的影响较大。在实收资本模式或者折衷资本模式下，由于普遍要求公司设立时的最低资本额以及全部或部分比例的实缴资本到位，有时还要求相应的部门以及人员对出资的真实进行验资，从而使得此类资本模式下因资本瑕疵所引发的瑕疵公司情形较为普遍。而授权资本模式下，由于公司设立很少有最低资本额的法定要求，更不存在应缴资本比例以及验资等法定要求，故公司设立尽管也需要注明资本或股份，但至少公司不会因为股东所缴资本的多寡而难以成立，因而授权资本模式下因资本瑕疵所引发的瑕疵公司情形并不常见。
（3）章程瑕疵
这是指公司章程缺乏必载事项或所载事项与法律存有冲突之情形。具体又可分为公司目的瑕疵、公司名称瑕疵以及其它必载事项瑕疵。
3、公司设立瑕疵怎么办?
（1）确立公司瑕疵设立无效制度
由于公司设立无效与司法撤销的具体模式与法律后果均基本相同，因此我国不妨仿效日本、韩国公司法将二者分别加以规定，确立公司瑕疵设立无效制度即可。
（2）明确公司瑕疵设立无效的事由
关于公司瑕疵设立无效的事由，各国和地区公司法的规定不尽相同.具体情形主要是：
①公司章程欠缺或违法。如《德国股份法》第275条第1款规定：“章程不包含关于股本数额或关于经营对象的规定，或章程关于经营对象的规定为无效的，任何一名股东以及任何一名董事会和监事会成员，均可以提起宣告公司无效的诉讼。不得因其他理由提起此种诉讼。”
②股东无行为能力。如《法国商事公司法》第360条规定：“公司无效或修改公司章程行为的无效，只有根据本法的明文规定或规定合同无效的条款，始可宣布。第365条规定：“公司成立后，因股东的无行为能力，公司无效。”
③法院依职权确定的原因。如日本法的规定，公司设立无效是由法院根据股东申请依职权来判定的。法院依职权实际是法官按照基本的法律原则来确定，如果公司设立过程中有违法行为，均可认定为设立无效。我国可将公司设立无效的事由规定为如下几种：公司章程未包含股本数额或经营对象的规定;章程关于经营对象的规定无效;公司的设立或其他登记事项有伪造、变造文书;股东虚假出资等。
（3）规定公司设立瑕疵补正及无效阻止与迟延制度
为贯彻商法的企业维持原则并维护交易安全，我国应尽可能维持瑕疵设立公司的法律人格，并明确规定设立无效的阻止与迟延制度;首先，应规定除非公司经营对象严重违法或严重损害了社会公共利益，相关当事人在提起设立无效诉讼之前，应给予公司以通过合法程序对设立瑕疵予以补正的一定期限。只有在该期限届满之后仍未能补正瑕疵，才能行使诉权。其次，规定当事人行使公司设立无效诉讼请求权的期间，借鉴国外立法例的规定.该期间可为2年，并应为除斥期间。再次，为了防止请求权人滥用诉权，可规定原告败诉时，如果其有恶意或重大过失，应对公司承担连带赔偿责任。
（4）规定公司设立无效诉讼的原告
在国外，关于公司设立无效之诉原告的资格规定不—，如日本和韩国规定只有股东社员才能作为原告提起公司设立无效诉讼，《德国股份法》规定股东、董事、监事均可作为原告起诉。我国公司设立无效之诉的原告不宜限制过多，可为股东、董事、监事、债权人及其他利害关系人。
（5）明确规定公司设立无效判决与行政撤销登记不具有溯及力，并且股东和公司不得以此对抗善意第三人。
在法律效果上，公司设立无效判决与行政撤销将导致公司解散，但为了保护交易的安全，其应当不具有溯及力。
4、公司设立的风险防范
（1）出资问题带来的法律风险及防范
出资问题包括：虚假出资、抽逃出资、评估不实、出资财产权利瑕疵引发的法律风险。这之中最容易出现问题的是抽逃出资，抽逃出资是指出资人在公司成立后，将其所交纳的出资额暗中抽逃撤回，但其仍保留股东身份和原有的出资份额。对于这种行为，可报相关机关审查，一经查实，情节严重的，最高可被判处5 年有期徒刑，同时可以并处虚假出资额或者抽逃出资额10%的罚金。但是这对公司的运行肯定会有一定程度的影响，对公司而言，人和远比资和重要，所以在考虑与他人共同设立公司时，应该着重考虑人和。
（2）公司设立协议带来的法律风险及防范
作为公司章程的母版的公司设立协议，是指发起人为规范公司设立过程中各发起人的权利和义务而签署的协议。由于公司设立协议从本质上隶属民事法律关系中的合同，所有违反公司设立协议的行为，对出资人而言都是违约行为，适用合同法的有关规定。在公司不能依法成立的情形下，设立协议显得格外重要。同时，由于设立公司协议作为公司章程的一个母版，决定着章程的内容。因此，签订和完善公司设立协议意义重大。在设立公司协议时，应该有书面的设立协议并保证设立协议的合理性。
综上，公司存在设立瑕疵，解决方法为通过确立公司瑕疵设立无效制度，明确公司瑕疵设立无效的事由，规定公司设立瑕疵补正及无效阻止与迟延制度，规定公司设立无效诉讼的原告。明确规定公司设立无效判决与行政撤销登记不具有溯及力，并且股东和公司不得以此对抗善意第三人。
