工程造价审计收费通常采用基本收费+追加收费两部分组成，基本收费一般定为建设单位送审总造价的0.1--0.3%左右，追加收费一般定为中价机构审减金额的4--9%左右。
审计服务费用由建设单位支付，在工程投资中单独列支（国家财务部有相关规定）。
现在对工程审计收费标准，国家不做硬性规定，只是做指导价，具体价格可以与具体审计部门协商
工程审计包括两大类型：工程造价审计和竣工财务决算审计
造价审计一般是对单项、单位工程的造价进行审核，其审计过程与乙方的决算编制过程基本相同，即按照工程量套定额。这由造价工程师完成。
对于建设单位来说，由于造价审计只是审核单项、单位工程的合同造价，一个建设项目的总的支出是由很多单项、单位工程组成的，而且还有很多支出比如前期开发费用、工程管理杂费等是不需要造价审计的，所以还要有一个竣工财务决算审计，就是将造价工程师审定的，和未经造价工程师审核的所有支出加在一起，审查其是否有不合理支出，是否有挤占建设成本和计划外建设项目的现象等，来确定一个建设项目的总的造价。这由注册会计师完成。
有政府性投资的建设项目，一律要进行工程审计。即所有行政、事业单位的建设项目都要经过造价审计和财务决算审计。非政府性投资的建设项目，规模较大而且涉及的利害关系人较多的，必须进行工程造价审计，比如房开企业开发的房地产。企业建造自用的建设项目由企业决定是否审计。
但不管什么建设项目，必须具备一定的规模才需要审计，比如你为政府机关搭建一个简易车棚，造价1000元，这就不需要审计。
造价审计和工程财务决算审计均由建设方委托审计单位。
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