一、材料费
三大主材
建筑工程的三大主材为钢筋、水泥和木材。三大主材量大、总价值高，直接关系到工程质量问题。目前，三大主材的取得包括甲供材和施工企业自购，其中，甲供材一般占到为工程总造价的40%-60%，剩余部门则一般由施工企业自行采购。
地材及装饰性材料
地材分为硬材和软材，一般指砖、砂、石料、地毯和木地板等。按照《国家税务局关于简并增值税征收率有关问题的公告》（国家税务总局公告2014年第36号）规定：一般纳税人销售自产的下列货物，可选择按照简易办法依照3%征收率计算缴纳增值税，同时不得开具增值税专用发票。（1）建筑用和生产建筑材料所用的砂、土、石料。（2）以自己采掘的砂、土、石料或其他矿物连续生产的砖、瓦、石灰（不含粘土实心砖、瓦）。
混凝土
按照财税（2014）57号文通知及2014年第36号文，商品混凝土（仅限于以水泥为原料生产的水泥混凝土）增值税简易计征率统一调整为3%。因此，建筑施工企业购买的商品混凝土，如果是从按简易征收办法的供应商处采购的，则建筑施工企业只能获得增值税普通发票，而不能抵扣进项税金。由于混凝土占整个建安成本的比例较大，商品混凝土增值税的简易征收，降低了建筑施工企业的进项税额，这虽然减少了混凝土行业的税负，却增加了建筑施工企业的税负。
二、人工费
人工费是否可以进行进项抵扣，也是建筑施工企业税改前后的重要关注点。目前，人工费按如下两种方法征收营业税：
①根据《国家税务总局关于劳务承包行为征收营业税问题的批复》（国税函200693号）规定，施工企业提供施工劳务取得的收入适用于营业税“建筑业”税目，按照3%的税率缴纳营业税；
②当为对方提供劳务派遣服务时，建筑劳务企业应按“服务业”税目依照5%的税率缴纳营业税。该服务费为扣除相应工资及保险、公积金后的余额，按这种方式劳务公司实际税率非常低甚至接近零。
因此，如对建筑劳务企业按照11%增值税征税，由于人工成本无法取得进项税，必将导致劳务成本急剧上升、建筑施工企业税负增加。
三、机械费
机械费是指项目为组织施工提供的施工机械发生的费用，约占工程总造价的7%-8%，包括安拆费、场外运输费、折旧费、大修理费、经常修理费、燃料动力费、养路费及车船使用税。目前，建筑施工企业大多采用设备租赁的形式，由于动产租赁业可抵扣费用少，选择一般纳税人盒小规模纳税人进行机械租赁，对抵扣费用影响不大。即使部分企业选择小规模纳税人，缴纳3%增值税，企业可抵扣进项税仍随之减少，税负增加。
四、企业管理成本
“营改增”之后，企业的纳税方式和核算方式都将发生重大改变，企业管理也面临着重大调整和挑战。
纳税地点改变增加异地承接工程难度
由于营业税的缴纳税额计入地税机关的财政税收，而增值税是在建筑施工企业的所在地征收，且征收额计入国税局税收，这会大幅降低地方政府税收，引起建筑企业异地承接工程增加难度。
财务核算方式改变增加财务管理难度
建筑施工企业一般都是异地施工，改征增值税后，税收在项目所在地进行，这会大幅度增加企业本部的财务人员业务量；而且这过程中还涉及相关资料的往来传递、审核手机，也将增大企业的管理成本。
总之，建筑施工企业全面实施“营改增”存在诸多困难：首先，税改后建筑业的税率从3%调整到11%，理论和实际的进项抵扣存在较大差距，可能造成企业税负不增反减；第二，目前大部分建筑施工企业存在经营模式粗放的问题，企业自身能否积极应对税改，政府能否严格监督发票管理、税收管理等，尚存在不确定性；第三，建筑业涉及的产业众多，为保证“营改增”切实达到消除重复征税的目的，避免行业大幅波动并稳定发展，还需要由政府建立一个完整的税负链条。
